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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003555`

染色体: Chr07 坐标: 41391560-41392252 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003555`
名称	SmilChr07G003555
描述	uncharacterized SmilChr07G003555
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	41391560 - 41392252 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994224`
GeneID	`130994224`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994224`
原始查询	`SmilChr07G003555`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=35.2; qcov=0.839; evalue=1.42e-29; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid); PF19259 (Ty3_capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994224

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775244.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057775244.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057775244.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775244.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775244.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:41391602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr7:41391605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr7:41391614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B36,C72,C82
`Chr7:41391622`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	B107,B127,B138,B26,B52,B73,B90,B93,B94,B97,C16,C2,C32,C42,C54,C61,D1,D3,D8
`Chr7:41391631`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B7
`Chr7:41391631`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B7
`Chr7:41391632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C82
`Chr7:41391636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B22
`Chr7:41391641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A15,B126,B18,B22,B36,B45,B97,C17,C24,C55,C59,C72,C82,C9
`Chr7:41391643`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B22,C1
`Chr7:41391643`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B22,C1
`Chr7:41391645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B80,B93,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775244.1

230 aa

115

230

Ty3_capsid

PEG10_N-capsid

PF19259 Ty3_capsid 40-201 aa PF03732 PEG10_N-capsid 41-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775244.1`	Pfam	`PF19259`	Ty3_capsid	Domain	40	201	1.4e-10	41.6	Ty3 transposon capsid-like protein
`XP_057775244.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	41	120	2.4e-12	47.7	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919261.1
ATGCCGCCGAGAAGGAGATATAGAAATCAAGAAGAGGAAGAGGAGGAACAAAGAGAACCTACGACACCACCACCCCCTCCACAGCCAGAAAGAAGAATAGAAGAACTCTTTTTGAGGCAAAATCCACCTACCTTCAATGGGTCTGGAGATCCTGCTGAAACTGAAGAATGGATAAGAAGCATGGAGCGAATTTTTAGATTTCTGCGATGTGATGATCTCGAGCGTCTTATGTGTATGTCGTATCAGCTTAAGGGGTCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994224
ATGCCGCCGAGAAGGAGATATAGAAATCAAGAAGAGGAAGAGGAGGAACAAAGAGAACCTACGACACCACCACCCCCTCCACAGCCAGAAAGAAGAATAGAAGAACTCTTTTTGAGGCAAAATCCACCTACCTTCAATGGGTCTGGAGATCCTGCTGAAACTGAAGAATGGATAAGAAGCATGGAGCGAATTTTTAGATTTCTGCGATGTGATGATCTCGAGCGTCTTATGTGTATGTCGTATCAGCTTAAGGGGTCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775244.1
MPPRRRYRNQEEEEEEQREPTTPPPPPQPERRIEELFLRQNPPTFNGSGDPAETEEWIRSMERIFRFLRCDDLERLMCMSYQLKGSADFWWEAKQKTMTPEQMAALTWEQFKIALCEKYVPRSYRKKKETEFVNLRQGNKTVAEYDHLFCDLARYAPYRVDTGEKMSELFCSGLKQEIRVVLASQSVLSYAEALNRALDMELAMQPEKTSQISVPQSNPNPQMGNQPFSG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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