当前解析结果
SmilChr07G003559| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003559 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003559 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003559 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 41467997 - 41470657 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130992968 |
|---|---|
| GeneID | 130992968 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992968 |
| 原始查询 | SmilChr07G003559 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992968 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.80000 | XP_057773667.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057773667.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057773667.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057773667.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057773667.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:41468027 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | A10,A8,B94,C38,C72 |
Chr7:41468027 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A10,A8,B94,C38,C72 |
Chr7:41468044 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 5 | A16,B56,B96,C62,C80 |
Chr7:41468044 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | A16,B56,B96,C62,C80 |
Chr7:41468106 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B111,B30 |
Chr7:41468139 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A3 |
Chr7:41468141 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B62,B73 |
Chr7:41468155 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C63,C69 |
Chr7:41468167 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B72,B98,C45,C62 |
Chr7:41468170 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B140,C40 |
Chr7:41468194 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 48 | A11,A18,A23,A4,B12,B122,B123,B124,B126,B128,B130,B132,B138,B15,B19,B27,B28,B32,B34,B38,B39,B40,B48,B50,B57,B58,B67,B73,C11,C16,C23,C25,C35,C38,C39,C43,C49,C50,C62,C67,C69,C75,C77,C78,C79,C84,D3,D5 |
Chr7:41468198 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C87 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。