当前解析结果
SmilChr07G003566| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003566 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003566 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003566 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 41655369 - 41656204 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130992967 |
|---|---|
| GeneID | 130992967 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992967 |
| 原始查询 | SmilChr07G003566 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992967 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057773666.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057773666.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057773666.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057773666.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057773666.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:41655442 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B59 |
Chr7:41655463 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C46 |
Chr7:41655479 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C31,C39,C44 |
Chr7:41655480 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B59,C17 |
Chr7:41655483 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B12,B132,B27,B5,B9 |
Chr7:41655491 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B50,B55,C74 |
Chr7:41655502 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B12,B132,B27,B5,B9 |
Chr7:41655622 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B24 |
Chr7:41655628 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 27 | A19,B104,B109,B129,B130,B15,B22,B32,B35,B47,B49,B6,B63,B83,B84,B85,B9,C1,C10,C29,C31,C45,C48,C53,C62,D4,D5 |
Chr7:41655667 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B100,C51 |
Chr7:41655680 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B110,B114,B79,C39,C72 |
Chr7:41655712 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B1,B104,B131 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。