当前解析结果
SmilChr07G003581| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003581 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003581 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003581 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 41853247 - 41855404 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130992985 |
|---|---|
| GeneID | 130992985 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992985 |
| 原始查询 | SmilChr07G003581 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992985 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057773679.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.80000 | XP_057773679.1 |
| 3 | Telomere | 端粒 | 0.20000 | XP_057773679.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057773679.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057773679.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:41853439 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr7:41853491 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B108,C15,C51 |
Chr7:41853771 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A14,A8,B3,B88 |
Chr7:41853938 |
CAT |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 78 | A10,A14,A16,A19,A24,A3,A7,A9,B10,B103,B107,B108,B109,B119,B120,B121,B122,B124,B125,B127,B133,B134,B137,B18,B21,B22,B26,B30,B35,B42,B46,B56,B59,B60,B64,B66,B67,B70,B77,B79,B81,B82,B84,B85,B93,B96,B97,C13,C15,C16,C17,C22,C23,C26,C32,C33,C34,C36,C37,C4,C41,C45,C47,C49,C5,C57,C59,C68,C73,C74,C76,C79,C8,C81,C82,C87,D1,D4 |
Chr7:41853972 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr7:41854515 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B72 |
Chr7:41854515 |
AC |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B72 |
Chr7:41854678 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | D11 |
Chr7:41854678 |
A |
AT |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr7:41854683 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr7:41854695 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 31 | A22,B110,B111,B113,B131,B132,B23,B27,B34,B47,B72,B83,B95,C24,C25,C27,C29,C30,C35,C38,C39,C50,C52,C54,C56,C57,C59,C63,C9,D10,D11 |
Chr7:41854727 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B52,B86 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。