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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003597`

染色体: Chr07 坐标: 42055671-42060626 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003597`
名称	SmilChr07G003597
描述	protein NLP7
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	42055671 - 42060626 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992845`
GeneID	`130992845`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992845`
原始查询	`SmilChr07G003597`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NLP7
产物	protein NLP7
Arabidopsis	`AT4G24020` (NLP7) NIN like protein 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828502] identity=54.2; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0236700` (NLP3) - identity=47.7; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00564 (PB1); PF02042 (RWP-RK); PF22922 (GAF_NLP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992845

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773587.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773587.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773587.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773587.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057773587.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:42056044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr7:42056379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B72
`Chr7:42056437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr7:42056562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr7:42056581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr7:42056689`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C59
`Chr7:42056991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr7:42057515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,B86
`Chr7:42057701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,C14,C5,D10,D8
`Chr7:42057709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr7:42057827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr7:42057970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B55,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773587.1

985 aa

492

985

GAF_NLP

RWP-RK

PB1

PF22922 GAF_NLP 295-479 aa PF02042 RWP-RK 575-649 aa PF00564 PB1 890-971 aa

XP_057773588.1

958 aa

479

958

GAF_NLP

RWP-RK

PB1

PF22922 GAF_NLP 295-479 aa PF02042 RWP-RK 575-655 aa PF00564 PB1 863-944 aa

XP_057773589.1

923 aa

462

923

GAF_NLP

RWP-RK

PB1

PF22922 GAF_NLP 295-479 aa PF02042 RWP-RK 575-648 aa PF00564 PB1 828-909 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773587.1`	Pfam	`PF22922`	GAF_NLP	Domain	295	479	2.9e-84	281.6	NLP protein GAF domain
`XP_057773587.1`	Pfam	`PF02042`	RWP-RK	Domain	575	649	1.7e-27	96.1	RWP-RK domain
`XP_057773587.1`	Pfam	`PF00564`	PB1	Domain	890	971	3.6e-18	66.0	PB1 domain
`XP_057773588.1`	Pfam	`PF22922`	GAF_NLP	Domain	295	479	2.7e-84	281.7	NLP protein GAF domain
`XP_057773588.1`	Pfam	`PF02042`	RWP-RK	Domain	575	655	8.3e-28	97.1	RWP-RK domain
`XP_057773588.1`	Pfam	`PF00564`	PB1	Domain	863	944	3.5e-18	66.1	PB1 domain
`XP_057773589.1`	Pfam	`PF22922`	GAF_NLP	Domain	295	479	2.4e-84	281.9	NLP protein GAF domain
`XP_057773589.1`	Pfam	`PF02042`	RWP-RK	Domain	575	648	4.1e-24	85.2	RWP-RK domain
`XP_057773589.1`	Pfam	`PF00564`	PB1	Domain	828	909	3.7e-18	66.0	PB1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917604.1
AAAAAAAAGACAAAAAGGGTGAAGAGTGGGGGCGTGGAACAGAGGAACAATTCCCTATTCTTTATCCCTTCAATTCGTGAGCAAGTAGACAGACGAGACGACTATTTACTATTAGATTCCACCAATTTTTGTAAAATGGAGCTGGAATCACCATTTCATCATCATCCCTTTCTCTCTCTCTCCTCCACACAACTCCCCCCTCCCCTAGAGAGAGAAAATGCCCTCCGAACCCGAAGACGACACCACCCGCCGCCCTCCGG...

XM_057917606.1
GGAACAATTCCCTATTCTTTATCCCTTCAATTCGTGAGCAAGTAGACAGACGAGACGACTATTTACTATTAGATTCCACCAATTTTTGTAAAATGGAGCTGGAATCACCATTTCATCATCATCCCTTTCTCTCTCTCTCCTCCACACAACTCCCCCCTCCCCTAGAGAGAGAAAATGCCCTCCGAACCCGAAGACGACACCACCCGCCGCCCTCCGGAGGTCCTCATGGACTTGGATCTCGATCTCGACGCTTCCTGGCC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130992845
ATGCCCTCCGAACCCGAAGACGACACCACCCGCCGCCCTCCGGAGGTCCTCATGGACTTGGATCTCGATCTCGACGCTTCCTGGCCCTTGGATCAGATCTTCGCCGCCGCTGCTGCCAACTGCCCCGCCCCGCCCTTCCTTCTCTCCACCTCCGACCAGCCCTGCTCCCCGCTTTGGGCCTTTTCCGATGATAATAACACCGCAAATCTTGTCGCCGGCACGGGTTTCCGCTTCTCCGACTCCTCCAAGATATTCTCCTA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057773587.1
MPSEPEDDTTRRPPEVLMDLDLDLDASWPLDQIFAAAAANCPAPPFLLSTSDQPCSPLWAFSDDNNTANLVAGTGFRFSDSSKIFSYSGNPEAATEGAVDNYDKKKLPTPLMGLMPMDNPDGSCIIKQRMTQALRYFKDLTEQHVLAQVWAPVKNGSRYVLTTSGQPFVLDPNSNGLHQYRLVSLSYMFSVDGDTDGDLGLPGRVFRQKLPEWTPNVQYYTSKEFPRLSHALNYNVRGTLALPVFEPSGQSCVGVLELIM...

XP_057773588.1
MPSEPEDDTTRRPPEVLMDLDLDLDASWPLDQIFAAAAANCPAPPFLLSTSDQPCSPLWAFSDDNNTANLVAGTGFRFSDSSKIFSYSGNPEAATEGAVDNYDKKKLPTPLMGLMPMDNPDGSCIIKQRMTQALRYFKDLTEQHVLAQVWAPVKNGSRYVLTTSGQPFVLDPNSNGLHQYRLVSLSYMFSVDGDTDGDLGLPGRVFRQKLPEWTPNVQYYTSKEFPRLSHALNYNVRGTLALPVFEPSGQSCVGVLELIM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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