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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003612`

染色体: Chr07 坐标: 42424214-42425078 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003612`
名称	SmilChr07G003612
描述	protein REDUCED CHLOROPLAST COVERAGE 3-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	42424214 - 42425078 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994240`
GeneID	`130994240`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994240`
原始查询	`SmilChr07G003612`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein REDUCED CHLOROPLAST COVERAGE 3-like
产物	protein REDUCED CHLOROPLAST COVERAGE 3-like
Arabidopsis	`AT1G15290` (AT1G15290) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838097] identity=59.1; qcov=1.02; evalue=2.77e-57; confidence=high
Rice	`Os04g0645100` (FLO2) - identity=60; qcov=1.03; evalue=7.95e-58; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006996 (organelle organization)
KEGG	-
Pfam	PF12807 (eIF3_p135)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994240

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775262.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775262.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775262.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775262.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775262.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:42424317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B103,B21
`Chr7:42424319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr7:42424422`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B103,C59
`Chr7:42424478`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A25,B83,C19,C85
`Chr7:42424478`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A25,B83,C19,C85
`Chr7:42424740`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B133,B134,B16,B67,D9
`Chr7:42424740`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B133,B134,B16,B67,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775262.1

151 aa

151

eIF3_p135

PF12807 eIF3_p135 1-45 aa PF12807 eIF3_p135 56-94 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775262.1`	Pfam	`PF12807`	eIF3_p135	Family	1	45	2.1e-13	51.4	Translation initiation factor eIF3 subunit 135
`XP_057775262.1`	Pfam	`PF12807`	eIF3_p135	Family	56	94	2.1e-13	51.4	Translation initiation factor eIF3 subunit 135

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919279.1
CTTCCGCATATACAGTCTCTTTGTATTCATGAAATGGTTACGCGAGCTTATAAGCATGTAGTTCGAGCTGTTATTGCTTCTGTTGAGAGCATGGATAACATGTCTGCTGCTATAGCCACAACATTAAATTTCTTGCTGGGGTCCTGCAATGCTGAAAGCAGCGATCAGACTCTTAAATTGCAATGGTTGCGGGCAATTTTGGAGAAAAGATTTGGTTGGAAATTGAAAGATGAACTACAACACTTGAGAAAGTTATCGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994240
ATGGTTACGCGAGCTTATAAGCATGTAGTTCGAGCTGTTATTGCTTCTGTTGAGAGCATGGATAACATGTCTGCTGCTATAGCCACAACATTAAATTTCTTGCTGGGGTCCTGCAATGCTGAAAGCAGCGATCAGACTCTTAAATTGCAATGGTTGCGGGCAATTTTGGAGAAAAGATTTGGTTGGAAATTGAAAGATGAACTACAACACTTGAGAAAGTTATCGATTCTGAGGGGTCTTTGTCATAAGGTTGGGTTAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775262.1
MVTRAYKHVVRAVIASVESMDNMSAAIATTLNFLLGSCNAESSDQTLKLQWLRAILEKRFGWKLKDELQHLRKLSILRGLCHKVGLELVPKDYDLECSTPFTNSHIISLVPICKRVGCSSADGRTLLESSKIALDKGKLEDAVNYGTKNTM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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