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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003618`

染色体: Chr07 坐标: 42547524-42552521 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003618`
名称	SmilChr07G003618
描述	probable transcription factor KAN2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	42547524 - 42552521 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995677`
GeneID	`130995677`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995677`
原始查询	`SmilChr07G003618`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable transcription factor KAN2
产物	probable transcription factor KAN2
Arabidopsis	`AT1G32240` (KAN2) Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840116] identity=45.8; qcov=1.2; evalue=4.19e-81; confidence=high
Rice	`Os08g0160300` - identity=36.1; qcov=1.1; evalue=2.97e-51; confidence=medium
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0010158 (abaxial cell fate specification)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995677

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777034.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777034.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777034.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777034.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057777034.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:42551533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr7:42551861`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B93,C37,C82
`Chr7:42551861`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B93,C37,C82
`Chr7:42551957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,C32,C68
`Chr7:42551991`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B113
`Chr7:42551991`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B113
`Chr7:42552180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777035.1

328 aa

164

328

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 159-210 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777035.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	159	210	1.5e-06	28.9	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921052.1
ACCCCCACGTCCACAACCACAAAGCCCTCCCTCTCTACCCCCTACCCCTACCTCTCCCAATTGCTCTTCAAGTGTCATTTTCTCATATATACTTCACACAAAAGAAACAACCATTCACTTCGAACCTTTGTCACTTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAATAATCTGTGCAACTAATCCTCCCAACTCCTCATCAAACCCCAGCCCACAAATCCTGTCTGCCTCCTGAAACTTGTGCATCCAAATCCATAAGAAGAAAACTGAA...

XM_057921051.1
CACAACCACAAAGCCCTCCCTCTCTACCCCCTACCCCTACCTCTCCCAATTGCTCTTCAAGTGTCATTTTCTCATATATACTTCACACAAAAGAAACAACCATTCACTTCGAACCTTTGTCACTTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAATAATCTGTGCAACTAATCCTCCCAACTCCTCATCAAACCCCAGCCCACAAATCCTGTCTGCCTCCTGAAACTTGTGCATCCAAATCCATAAGAAGAAAACTGAATAATCACATAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995677
ATGGAGCTGTTTCCAGCACAGCCAGACCTTTCGTTGCGAATCAGCCCTCTAAACAGCACCACCTCATCAAACTGGAGAAGAGGTGAAGAAGAAATGGATTTGGGGTTTTGGAAGCGAGCTCTAGAGTCCAGAACCTCCCTCTCTTCAATGGCCAAAGCCGACCTCCCCCTCTCAAATCCCGCTAGGGTTTCGGACCCCCTCACCGCCCCCAACCACCACCGCATCCTCCATCCCCGGCCGCAGCTGGACGAGGAAGTGAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777034.1
MELFPAQPDLSLRISPLNSTTSSNWRRGEEEMDLGFWKRALESRTSLSSMAKADLPLSNPARVSDPLTAPNHHRILHPRPQLDEEVSLLKPIRGIPVYQNPPSFPFAAHHHQQQRHLEASFASVNHLATASVAPYTSQALMRSRFLSRFPAKRSMRAPRMRWTTTLHARFVHAVELLGGHERATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQFLQMYRTVKSTDRASAYSGNVDALENGSSGDTSDEFLFDIQNSHKSEVSVEKG...

XP_057777035.1
MELFPAQPDLSLRISPLNSTTSSNWRRGEEEMDLGFWKRALESRTSLSSMAKADLPLSNPARVSDPLTAPNHHRILHPRPQLDEEVSLLKPIRGIPVYQNPPSFPFAAHHHQQQRHLEASFASVNHLATASVAPYTSQALMRSRFLSRFPAKRSMRAPRMRWTTTLHARFVHAVELLGGHERATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMYRTVKSTDRASAYSGNVDALENGSSGDTSDEFLFDIQNSHKSEVSVEKGRQF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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