当前解析结果
SmilChr07G003633| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003633 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003633 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003633 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 42987297 - 42987854 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994247 |
|---|---|
| GeneID | 130994247 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994247 |
| 原始查询 | SmilChr07G003633 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=34.2; qcov=1.04; evalue=1.73e-19; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994247 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057775268.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057775268.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057775268.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775268.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775268.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:42987329 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B136,C57 |
Chr7:42987339 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B2,B91 |
Chr7:42987344 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B72 |
Chr7:42987360 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B109,C76,C83 |
Chr7:42987364 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B101,B24,B53,D5,D6 |
Chr7:42987457 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C25 |
Chr7:42987503 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B101,B24,B53,D5,D6 |
Chr7:42987520 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B129,B72,C37,C60 |
Chr7:42987577 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B101,B24,B53,D5,D6 |
Chr7:42987580 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C35 |
Chr7:42987582 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B11,B53,C3 |
Chr7:42987586 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B21,B33,B78,C26 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。