当前解析结果
SmilChr07G003639| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003639 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003639 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003639 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 43105439 - 43106584 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994250 |
|---|---|
| GeneID | 130994250 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994250 |
| 原始查询 | SmilChr07G003639 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=24.8; qcov=0.53; evalue=1.28e-09; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994250 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057775271.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057775271.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057775271.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057775271.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775271.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:43105458 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B88,B98 |
Chr7:43105460 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 16 | A8,B100,B123,B140,B24,B30,B45,B46,B49,B5,C11,C26,C3,C41,C46,C66 |
Chr7:43105462 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B106 |
Chr7:43105473 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B130,C36,C42,C73,C75 |
Chr7:43105480 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B24 |
Chr7:43105504 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B106,B111,B134 |
Chr7:43105517 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A23,B129,B139,C7,C76 |
Chr7:43105539 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 68 | A11,A20,A23,A25,A8,A9,B100,B102,B105,B107,B11,B112,B115,B121,B123,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B15,B19,B22,B24,B33,B34,B37,B39,B40,B45,B46,B49,B5,B50,B52,B56,B59,B6,B63,B66,B68,B7,B73,B74,B77,B78,B99,C10,C11,C15,C22,C24,C25,C26,C27,C37,C38,C41,C46,C6,C62,C66,C68,C7,C83,D3,D9 |
Chr7:43105545 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr7:43105550 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B119,B86,C33,C40,C68 |
Chr7:43105556 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B107 |
Chr7:43105558 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A10,B100,B13,B91,C61 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。