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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003649`

染色体: Chr07 坐标: 43327087-43330985 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003649`
名称	SmilChr07G003649
描述	binding partner of ACD11 1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	43327087 - 43330985 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993096`
GeneID	`130993096`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993096`
原始查询	`SmilChr07G003649`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	binding partner of ACD11 1-like
产物	binding partner of ACD11 1-like
Arabidopsis	`AT4G17720` (AT4G17720) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827493] identity=70; qcov=0.95; evalue=2.93e-128; confidence=high
Rice	`Os04g0594400` - identity=54.5; qcov=1.14; evalue=3.04e-108; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993096

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057773802.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057773802.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057773802.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057773803.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773802.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:43327505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B77
`Chr7:43327730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,A21,B20
`Chr7:43328231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr7:43328397`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:43328439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B87,C60
`Chr7:43328472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773802.1

282 aa

141

282

RRM_1

PF00076 RRM_1 8-67 aa

XP_057773803.1

281 aa

140

281

RRM_1

PF00076 RRM_1 7-66 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773802.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	8	67	1.6e-08	35.0	RNA recognition motif
`XP_057773803.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	7	66	1.6e-08	35.0	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917820.1
GCTTAACCTTTAGAACGTGAGCTCACATAATTTATGTTGATGGAAACGTGCATGTGGATACGTACATTTTCGCCAATTAAAAATATTTGATTTAGATTTTAAATTTTAAAAGATTAGTCGCGTTTGAACCAATAAATAATAGCGGGCCCAACTCCTTGACGCTCCAACCGCGTGGAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATCAACCAAATTTGATTTGCAACTCAGCTTGTGTCAACGCAACGCCCCTCGATTCATCTGCC...

XM_057917819.1
ATGTCCCAGATAAAAACTGTCAAGGTCAGTAATCTGTCTCTGGGAGCATCAGAGCGTGACGTCCACGAGTTCTTTTCTTTTTCTGGTGATATTGAATATGTCGAGATGCGAAGTGATACTGTGCGATCTCAAATTGCATTTGTTACCTTCAAGGACGTGCAGGGAGCGGAGACTGCAATCCTTCTTTCGGGAGCAACAATTATAGACATGACTGTGGAAATTAATCCAGATCCAGATTACAAGCTACCTCCTGCTGCTTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130993096
ATGTCGATAAAAACTGTCAAGGTCAGTAATCTGTCTCTGGGAGCATCAGAGCGTGACGTCCACGAGTTCTTTTCTTTTTCTGGTGATATTGAATATGTCGAGATGCGAAGTGATACTGTGCGATCTCAAATTGCATTTGTTACCTTCAAGGACGTGCAGGGAGCGGAGACTGCAATCCTTCTTTCGGGAGCAACAATTATAGACATGACTGTGGAAATTAATCCAGATCCAGATTACAAGCTACCTCCTGCTGCTTGTGC...

LOC130993096
ATGTCCCAGATAAAAACTGTCAAGGTCAGTAATCTGTCTCTGGGAGCATCAGAGCGTGACGTCCACGAGTTCTTTTCTTTTTCTGGTGATATTGAATATGTCGAGATGCGAAGTGATACTGTGCGATCTCAAATTGCATTTGTTACCTTCAAGGACGTGCAGGGAGCGGAGACTGCAATCCTTCTTTCGGGAGCAACAATTATAGACATGACTGTGGAAATTAATCCAGATCCAGATTACAAGCTACCTCCTGCTGCTTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773802.1
MSQIKTVKVSNLSLGASERDVHEFFSFSGDIEYVEMRSDTVRSQIAFVTFKDVQGAETAILLSGATIIDMTVEINPDPDYKLPPAACAPPLQSDKRTGGGAESALQKAEDVVSSMLAKGFILGKDAVNKAKSFDEKHQLTSTASAKVSSIDKKIGLTEKITIGTSIVNDKVREVDEKLHVSEKAKSAFAAAEQTVSNAGSAIMKNRYVLTGTTWVTGAFSKVTKAAGEVGQKTKEKVVIVEDEQRRKMVDDFAQVHLSES...

XP_057773803.1
MSIKTVKVSNLSLGASERDVHEFFSFSGDIEYVEMRSDTVRSQIAFVTFKDVQGAETAILLSGATIIDMTVEINPDPDYKLPPAACAPPLQSDKRTGGGAESALQKAEDVVSSMLAKGFILGKDAVNKAKSFDEKHQLTSTASAKVSSIDKKIGLTEKITIGTSIVNDKVREVDEKLHVSEKAKSAFAAAEQTVSNAGSAIMKNRYVLTGTTWVTGAFSKVTKAAGEVGQKTKEKVVIVEDEQRRKMVDDFAQVHLSESP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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