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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003653`

染色体: Chr07 坐标: 43449578-43450054 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003653`
名称	SmilChr07G003653
描述	uncharacterized SmilChr07G003653
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	43449578 - 43450054 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994253`
GeneID	`130994253`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994253`
原始查询	`SmilChr07G003653`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF31073 (DUF8803)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994253

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775275.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057775275.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775275.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775275.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775275.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:43449622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B76
`Chr7:43449623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B131,B136,B15
`Chr7:43449648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	143	A10,A13,A15,A16,A19,A2,A21,A24,A25,A3,A4,A5,A7,A9,B1,B10,B100,B101,B105,B106,B107,B108,B11,B113,B114,B118,B12,B120,B123,B124,B125,B126,B128,B129,B13,B130,B135,B136,B139,B14,B19,B2,B20,B22,B24,B27,B28,B30,B32,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B40,B41,B42,B44,B45,B48,B49,B5,B53,B57,B58,B59,B61,B63,B65,B67,B69,B7,B72,B78,B79,B80,B81,B82,B83,B86,B89,B90,B91,B92,B93,B94,B96,B98,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C17,C18,C19,C2,C20,C27,C28,C29,C3,C30,C33,C34,C35,C37,C39,C4,C40,C44,C45,C46,C47,C49,C5,C51,C53,C55,C56,C57,C58,C59,C60,C63,C65,C70,C72,C76,C79,C8,C80,C81,C83,C85,C87,D11,D3,D5,D8,D9
`Chr7:43449649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A5,B103,B111,B112,B13,B32,B50,B96,C14,C24,C25,C33,C55,C60
`Chr7:43449659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B10
`Chr7:43449671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	54	A1,A14,A19,A20,A21,A23,A24,B100,B127,B128,B14,B15,B17,B18,B2,B20,B26,B27,B31,B37,B4,B40,B42,B47,B49,B54,B56,B57,B59,B64,B68,B7,B85,B9,B90,B92,B95,B99,C12,C21,C28,C39,C40,C54,C60,C61,C66,C74,C79,C83,C84,D10,D6,D8
`Chr7:43449676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr7:43449722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B124,C19,C28,C73
`Chr7:43449728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B21,C1
`Chr7:43449766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,A25,B20,B76,B92
`Chr7:43449767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B9,C26
`Chr7:43449787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B56,B92,C38,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775275.1

158 aa

158

DUF8803

PF31073 DUF8803 88-139 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775275.1`	Pfam	`PF31073`	DUF8803	Domain	88	139	1.1e-07	32.3	Domain of unknown function (DUF8803)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919292.1
ATGTCACCTTATCGTCTAATCTTTGGGAAGATGTGCCACCTACCGGTTGAGTTAGAGCATCGCGCATATTGGGCCGTGAAAGAAGTGAATAAGCAGTTGCCTAAGTGTGAGGAGGAAAGGAAGTTTCAACTTCAAGAATTGGAGGAGATTCGTCTTGAAGCATATGATGCAGCCATGTGGTATAAAGAGCGCACTAAGATGTGGCATGACAAGAATCTGCGAGGGAAATCCTTGAAGGTCGGGCAAAAGGTACTCTTGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994253
ATGTCACCTTATCGTCTAATCTTTGGGAAGATGTGCCACCTACCGGTTGAGTTAGAGCATCGCGCATATTGGGCCGTGAAAGAAGTGAATAAGCAGTTGCCTAAGTGTGAGGAGGAAAGGAAGTTTCAACTTCAAGAATTGGAGGAGATTCGTCTTGAAGCATATGATGCAGCCATGTGGTATAAAGAGCGCACTAAGATGTGGCATGACAAGAATCTGCGAGGGAAATCCTTGAAGGTCGGGCAAAAGGTACTCTTGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775275.1
MSPYRLIFGKMCHLPVELEHRAYWAVKEVNKQLPKCEEERKFQLQELEEIRLEAYDAAMWYKERTKMWHDKNLRGKSLKVGQKVLLFQSKLRLMPGKLKTKWVGPFVIQSVCPNGAFEIRSLDMAKTFTVNGQRLKPFYDASSLVPAESVSLLVPGIF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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