当前解析结果
SmilChr07G003676| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003676 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003676 |
| 描述 | pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 1 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 44191087 - 44192055 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994258 |
|---|---|
| GeneID | 130994258 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994258 |
| 原始查询 | SmilChr07G003676 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 1 |
| 产物 | pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 1 |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994258 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057775282.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057775282.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057775282.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775282.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775282.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:44191239 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B47 |
Chr7:44191269 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B17 |
Chr7:44191297 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A7,B17,C23 |
Chr7:44191307 |
G |
GC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B17 |
Chr7:44191307 |
G |
GC |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | B17 |
Chr7:44191319 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A7,C23 |
Chr7:44191381 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B22,B69,C41 |
Chr7:44191410 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C35,C40 |
Chr7:44191503 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B74,C16 |
Chr7:44191511 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B74,C16 |
Chr7:44191612 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B74,C16 |
Chr7:44191626 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B87 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。