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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003677`

染色体: Chr07 坐标: 44211310-44214779 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003677`
名称	SmilChr07G003677
描述	transcription factor bHLH71
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	44211310 - 44214779 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996269`
GeneID	`130996269`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996269`
原始查询	`SmilChr07G003677`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor bHLH71
产物	transcription factor bHLH71
Arabidopsis	`AT1G72210` (AT1G72210) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843553] identity=52.3; qcov=0.896; evalue=5.89e-77; confidence=high
Rice	`Os02g0691500` (OsbHLH049) - identity=50.7; qcov=0.909; evalue=2.04e-80; confidence=high
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996269

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777762.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777762.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777762.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777762.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057777762.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:44212276`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C82,D7
`Chr7:44213632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr7:44213647`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B87
`Chr7:44213647`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B87
`Chr7:44213723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B91
`Chr7:44213852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777762.1

297 aa

148

297

HLH

PF00010 HLH 85-136 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777762.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	85	136	3.6e-13	49.8	Helix-loop-helix DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921779.1
ATTTAAAATTAATTATATATAATTAGGAATTAACATATTACAAAAGAATTCAAATAATTGAGCCATAACAATGAAACTAGACTTAAAAGGGAACTACATACGGTCACACTTAGTTAAATCAAATTAATGACATTTTCGTTAAGATAGTGTACGATGTCTCATTTTTATCGCTTGATGAATTAAATATTATCAGTAATATGTTACTATCGAGATTTAATTTTTAATTTTTTGCAATAATAATAATATTAAATTTTTTCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996269
ATGACTATGGAAGCACTTTCTTCAAGTGAGCTCTTGAATTTCATCATGTATGACACAAACGTCTCCGCCCCATTGAGCTGCAACAACAATGACTCCTCCGAAGCCAGCCCTCGCGAGATTGGGAGCTGCTCCTCCAGGCCGCGGCCGACCCACCCGCCGCCGCCGCCCGAAACGGCCAGCGTAGCGCTGCAGGGCCGCAAGAAGCGGCGGCGGAGGCCCAAGGTGTGCAAGAACAAAGAGGAAGCCGAGACTCAGAGAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777762.1
MTMEALSSSELLNFIMYDTNVSAPLSCNNNDSSEASPREIGSCSSRPRPTHPPPPPETASVALQGRKKRRRRPKVCKNKEEAETQRMTHIAVERNRRKQMNEHLAVLRSLMPDSYVQRGDQASIVGGAIEFVKELEHILQSLEAKKFALLEHGNVTNKEHHDDEEIRNDDRNLGSPFAQFFAYPQFSCSHSQVSNKYTSQSKAAIADIEVTLIETHANIRVLSRRRVRQLSKMVASFQSIFLAILHLNVTTLDTLVLYSI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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