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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003693`

染色体: Chr07 坐标: 44464182-44465979 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003693`
名称	SmilChr07G003693
描述	uncharacterized SmilChr07G003693
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	44464182 - 44465979 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996268`
GeneID	`130996268`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996268`
原始查询	`SmilChr07G003693`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Aminotransferase-like, plant mobile domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841505]; symbol=AT1G50830; hit=AT1G50830; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Aminotransferase-like, plant mobile domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841505]; symbol=AT1G50830; hit=AT1G50830; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G50830` (AT1G50830) Aminotransferase-like, plant mobile domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841505] identity=24.1; qcov=0.533; evalue=3.12e-11; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10536 (PMD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996268

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777761.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777761.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777761.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777761.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057777761.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:44464192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr7:44464202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr7:44464204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C4,D10
`Chr7:44464222`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B100,B102,D3
`Chr7:44464231`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B110,B124,B16,B6,C22,C67
`Chr7:44464233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr7:44464266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B102,D10,D11,D3
`Chr7:44464307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr7:44464321`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	37	A14,A18,A24,A5,B113,B114,B125,B130,B24,B27,B38,B39,B42,B43,B48,B49,B53,B57,B69,B77,B79,B83,B97,B98,C13,C16,C20,C37,C38,C44,C52,C54,C61,C76,C78,D2,D6
`Chr7:44464349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B104
`Chr7:44464349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:44464380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B27,B57,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777761.1

537 aa

268

537

PMD

PF10536 PMD 43-288 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777761.1`	Pfam	`PF10536`	PMD	Domain	43	288	1.2e-18	68.2	Plant mobile domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921778.1
ACCACGCATGGAGAAGAAGTCGGTGCGGTCTAAAGCCACGCACAATCCTACCGGCGAGTTTCGAGCTCACGAACCATGGTCGTCCGTCGAGAAGGGTTTATTTTTGAAGCTTAAGATTGACGAGAGTTATTGGGACGAGACTTACTTGGCGGCGTATCTTGCTTGTTGGCTTTGCTCTTTCGTTCTTCCCGAAGGTGACGCCACATTGATTCGGCCGAGCACATTTAAAATGGCGTGCATCATGGCGACTCAACAAAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996268
ATGGAGAAGAAGTCGGTGCGGTCTAAAGCCACGCACAATCCTACCGGCGAGTTTCGAGCTCACGAACCATGGTCGTCCGTCGAGAAGGGTTTATTTTTGAAGCTTAAGATTGACGAGAGTTATTGGGACGAGACTTACTTGGCGGCGTATCTTGCTTGTTGGCTTTGCTCTTTCGTTCTTCCCGAAGGTGACGCCACATTGATTCGGCCGAGCACATTTAAAATGGCGTGCATCATGGCGACTCAACAAAAGGTGGCTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777761.1
MEKKSVRSKATHNPTGEFRAHEPWSSVEKGLFLKLKIDESYWDETYLAAYLACWLCSFVLPEGDATLIRPSTFKMACIMATQQKVALTVPVLASIFRGLNKISDSVEPFRLRAAFPAHFVYAWMAYYFKTHFPLERDSCTPKMVQYSGDGGARFYDNVKARKQIHKGDQVAWSFTMYSWDKDISFIDDENAKESEFCYFMAVRSNYLTRRLEDGFVVEPYSPHRFSRQFGFYQVRPGVLSPNFRKASLEDGLKYWDATVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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