当前解析结果
SmilChr07G003704| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003704 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003704 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003704 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 44699037 - 44700035 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994268 |
|---|---|
| GeneID | 130994268 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994268 |
| 原始查询 | SmilChr07G003704 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os12g0292200- identity=26; qcov=0.313; evalue=2.03e-06; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994268 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057775295.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057775295.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057775295.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775295.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775295.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:44699054 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B14,B94 |
Chr7:44699069 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B132,C35 |
Chr7:44699109 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | C58,D4 |
Chr7:44699109 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C58,D4 |
Chr7:44699123 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B84,C6,C78,D9 |
Chr7:44699128 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A14 |
Chr7:44699171 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B84,C6,C78,D9 |
Chr7:44699195 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A9,B14,B84,C6 |
Chr7:44699259 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B73 |
Chr7:44699271 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B108,B119,B122,B81 |
Chr7:44699284 |
ACT |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B59 |
Chr7:44699284 |
ACT |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B59 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。