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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003707`

染色体: Chr07 坐标: 44736032-44738258 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003707`
名称	SmilChr07G003707
描述	uncharacterized SmilChr07G003707
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	44736032 - 44738258 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994270`
GeneID	`130994270`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994270`
原始查询	`SmilChr07G003707`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=25.6; qcov=0.828; evalue=8.38e-53; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=32; qcov=0.81; evalue=2.48e-86; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994270

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775297.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775297.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775297.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775297.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775297.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:44736052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr7:44736126`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A2,B32,B4,B53,B78,C27,C37,C62
`Chr7:44736139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,B7,C40
`Chr7:44736140`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A5,C43
`Chr7:44736140`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A5,C43
`Chr7:44736177`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B93
`Chr7:44736177`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B93
`Chr7:44736181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr7:44736245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B128,C1,C49,C5
`Chr7:44736257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr7:44736260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B84,C82
`Chr7:44736289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775297.1

652 aa

326

652

MULE

SWIM

PF10551 MULE 158-244 aa PF04434 SWIM 392-420 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775297.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	158	244	2.2e-13	51.1	MULE transposase domain
`XP_057775297.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	392	420	1.7e-07	31.3	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919314.1
ATGAATGAGAAAGAGTGTCCCTTTCTCATGCATGTGTCCAAGGATGGTGATGCTGAGGGTTTGGTGATTAAGACTCTTATTCTAGAGCATACATGTTGCAAGCATAGGGAGGTACCTAGTGCTAGTCAGGGATACTTGGCTAAGTATTTCAAGCAAGCAGTTTATAGGAACCCAAAATACACCTCCAAGGACATGCAAGGTCATGTGAAAGACCATCTGAAATTGCATGTTAGTTTAGCCAAATGCAAGAGGGCAAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994270
ATGAATGAGAAAGAGTGTCCCTTTCTCATGCATGTGTCCAAGGATGGTGATGCTGAGGGTTTGGTGATTAAGACTCTTATTCTAGAGCATACATGTTGCAAGCATAGGGAGGTACCTAGTGCTAGTCAGGGATACTTGGCTAAGTATTTCAAGCAAGCAGTTTATAGGAACCCAAAATACACCTCCAAGGACATGCAAGGTCATGTGAAAGACCATCTGAAATTGCATGTTAGTTTAGCCAAATGCAAGAGGGCAAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775297.1
MNEKECPFLMHVSKDGDAEGLVIKTLILEHTCCKHREVPSASQGYLAKYFKQAVYRNPKYTSKDMQGHVKDHLKLHVSLAKCKRAKNEIICNLEGSYKEEFSRLCAYIEKVNECMPGSRLELQLSTEQLQAGKRVFKRLFVMLEPCRLNWLGGCRKLISLDGCHLKGATFGCLLTTVGKDGNEGIVPIAWAVVNKENKNNWRWFMNWLKQGLELGEGDEGLMEAIKEITPQTEHRWCARHIYANWSKKWRGEELKKRFWI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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