当前解析结果
SmilChr07G003714| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003714 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003714 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003714 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 44881784 - 44883139 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994273 |
|---|---|
| GeneID | 130994273 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994273 |
| 原始查询 | SmilChr07G003714 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994273 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057775299.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057775299.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.40000 | XP_057775299.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775299.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775299.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:44881785 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B130,B41,B45 |
Chr7:44881785 |
TA |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | B130,B41,B45 |
Chr7:44881806 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A11,B25 |
Chr7:44881843 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 8 | B120,B126,B44,B99,C38,C46,C66,C76 |
Chr7:44881850 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C71 |
Chr7:44881853 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A18,B1,C57 |
Chr7:44881861 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | A18,B1 |
Chr7:44881861 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A18,B1 |
Chr7:44881862 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B60 |
Chr7:44881864 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 8 | B1,B12,B130,B65,B79,C18,C4,C42 |
Chr7:44881867 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B18,B30,B95,B97,C57 |
Chr7:44881882 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B25 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。