当前解析结果
SmilChr07G003730| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003730 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003730 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003730 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 45307805 - 45310101 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994276 |
|---|---|
| GeneID | 130994276 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994276 |
| 原始查询 | SmilChr07G003730 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994276 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057775304.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057775304.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.60000 | XP_057775304.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.40000 | XP_057775304.1 |
| 5 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057775304.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:45307811 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | A14,A8,B3,B32,B81,B88 |
Chr7:45307826 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B137 |
Chr7:45307828 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C13,C58,D10 |
Chr7:45307835 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C36,D10 |
Chr7:45307852 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C36,C56 |
Chr7:45307857 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B137,C36,C56 |
Chr7:45307885 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B69,C41 |
Chr7:45307899 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B137,D4 |
Chr7:45307922 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 15 | B1,B106,B110,B12,B125,B40,B55,B71,B78,B90,B92,C50,C65,D1,D6 |
Chr7:45307925 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 11 | A2,B110,B131,B40,B65,B68,C13,C3,C35,C64,C76 |
Chr7:45307936 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C36 |
Chr7:45307945 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C37,D4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。