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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003732`

染色体: Chr07 坐标: 45372105-45378541 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003732`
名称	SmilChr07G003732
描述	AT-hook motif nuclear-localized protein 8-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	45372105 - 45378541 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992758`
GeneID	`130992758`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992758`
原始查询	`SmilChr07G003732`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT-hook motif nuclear-localized protein 8-like
产物	AT-hook motif nuclear-localized protein 8-like
Arabidopsis	`AT4G17950` (AT4G17950) AT hook motif DNA-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827520] identity=45.9; qcov=0.858; evalue=1.08e-67; confidence=high
Rice	`Os04g0589900` (OsAHP1) - identity=61.9; qcov=0.513; evalue=2.49e-68; confidence=medium
GO	GO:0003680 (minor groove of adenine-thymine-rich DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03479 (PCC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992758

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773485.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773485.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773485.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773485.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057773485.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:45372515`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C27,C63
`Chr7:45372751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr7:45377517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr7:45377715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B82,C8
`Chr7:45377746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr7:45377803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:45377938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr7:45378146`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C64
`Chr7:45378146`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773485.1

394 aa

197

394

PCC

PF03479 PCC 199-313 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773485.1`	Pfam	`PF03479`	PCC	Domain	199	313	5.2e-36	124.1	Plants and Prokaryotes Conserved (PCC) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917502.1
GAGTAGTAGTCATCCAAAATCGAATGGATTGGTAGGACTAAACCGTAGTGATGGGTTAATCACGAAAAAAGTAGGTATATTTATGTATGAGATCCGCATTAATAAACCTAGCTAGTAATAGTTAATTCACTTGAGATATAGATTTGGCCACCGAAATAGCAAAATACAAAATTATAAAACCCTAATTCTAAAACCCCCAGTGATCGCGCGAGCAAGCAAGCAAAGCAAGTCTCTTTCATAAATTCAGATTCCAAAATCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992758
ATGGATTCACAAGATTCCTCCGCTCCGCCACCCCACCACCACCACCACCACCACCCGCACCCCCACCCCCACCCCCACCCGCACCCGCAGCCGCCCTTCTCCGCCCACCACGCCATGCTGATGGGCCATCAGCACCCCCAAATTCAACAGCACCCCTCCAACAACTCCTACCTACTGCCCAACACCAACAATTCCGTCGCCCCAACCACCTCCGCCGCTGCCTCCAATTCCACCATGATGCACCAGCAGCAGCAGCAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773485.1
MDSQDSSAPPPHHHHHHHPHPHPHPHPHPQPPFSAHHAMLMGHQHPQIQQHPSNNSYLLPNTNNSVAPTTSAAASNSTMMHQQQQQNPRFPFNSMPAAPQKPLDHQFSDVSPSGSAGGWFSAEPARKKRGRPRKYSPDNSIGLGLSPAPVTQISPAGGHVDPGGGAGTPSSESQVKRHRGRPPGSGKKQLDALGIPGIGFTPHVITVNSGEDIASKIMAFSQQGPRTVCILSANGAISSVSLRQPATPSGQINYEGRYEI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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