当前解析结果
SmilChr07G003742| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003742 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003742 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003742 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 45620073 - 45620591 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994280 |
|---|---|
| GeneID | 130994280 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994280 |
| 原始查询 | SmilChr07G003742 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=35.1; qcov=0.86; evalue=3.26e-21; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994280 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057775309.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057775309.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057775309.1 |
| 4 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.20000 | XP_057775309.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775309.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:45620079 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B23,C16,C23 |
Chr7:45620080 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 5 | A5,C1,C17,C43,C65 |
Chr7:45620080 |
GT |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | A5,C1,C17,C43,C65 |
Chr7:45620082 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | A2,B28,C15,C45,C78 |
Chr7:45620082 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A2,B28,C15,C45,C78 |
Chr7:45620100 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A21,B102,B118,C2 |
Chr7:45620106 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B104,B105,C58 |
Chr7:45620106 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B104,B105,C58 |
Chr7:45620117 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C37 |
Chr7:45620130 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C37 |
Chr7:45620141 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A16,C84 |
Chr7:45620166 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B3,B7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。