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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003743`

染色体: Chr07 坐标: 45623319-45633964 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003743`
名称	SmilChr07G003743
描述	AP-2 complex subunit mu
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	45623319 - 45633964 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992767`
GeneID	`130992767`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992767`
原始查询	`SmilChr07G003743`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AP-2 complex subunit mu
产物	AP-2 complex subunit mu
Arabidopsis	`AT5G46630` (AT5G46630) Clathrin adaptor complexes medium subunit family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834706] identity=94.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0690700` - identity=95.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0006897 (endocytosis); GO:0030131 (clathrin adaptor complex); GO:0031410 (cytoplasmic vesicle)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00928 (Adap_comp_sub)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992767

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057773491.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057773492.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.80000	`XP_057773491.1`
4	Vesicle	囊泡	0.80000	`XP_057773491.1`
5	Endosome	内体	0.60000	`XP_057773491.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:45627102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:45633524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,A9,B134,B85,C4
`Chr7:45633585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B113,B119,C31,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773491.1

463 aa

232

463

Adap_comp_sub

PF00928 Adap_comp_sub 167-463 aa

XP_057773492.1

438 aa

219

438

Adap_comp_sub

PF00928 Adap_comp_sub 167-438 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773491.1`	Pfam	`PF00928`	Adap_comp_sub	Family	167	463	9.8e-90	301.1	Adaptor complexes medium subunit family
`XP_057773492.1`	Pfam	`PF00928`	Adap_comp_sub	Family	167	438	2.7e-94	316.0	Adaptor complexes medium subunit family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917508.1
TGATTTTGAAGGGGGGCTGAATATTCATCTTGACCAGAGCTCCAAAATATAAAAACCAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGGAAAGGCGCAGTAGTATACGAAAAAGCAGTTCGCTGACTGAAGAACGTCAAATTTGTTCAAGGAGAGCAGATCTCGTTTCTCATCTTAGTGGATCGGAGCTCCGGCGAGATCTCAGCCATGCCGGTGGCGGCGTCCGCGATTTACTTCCTCAATCTTCGCGGCGATGTCCTCATCAATCGCC...

XM_057917509.1
TGATTTTGAAGGGGGGCTGAATATTCATCTTGACCAGAGCTCCAAAATATAAAAACCAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGGAAAGGCGCAGTAGTATACGAAAAAGCAGTTCGCTGACTGAAGAACGTCAAATTTGTTCAAGGAGAGCAGATCTCGTTTCTCATCTTAGTGGATCGGAGCTCCGGCGAGATCTCAGCCATGCCGGTGGCGGCGTCCGCGATTTACTTCCTCAATCTTCGCGGCGATGTCCTCATCAATCGCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992767
ATGCCGGTGGCGGCGTCCGCGATTTACTTCCTCAATCTTCGCGGCGATGTCCTCATCAATCGCCTATACCGTGACGACGTCGGAGGCAACATGGTGGATGCTTTCCGAGTCCATATCATGCAAACAAAGGAACTTGGCACTTGTCCTGTTCGGCAGATTGGGGGATGCTCATTCTTTTACATGAGAATTAGCAATGTCTATATCGTGATTGTAGTAAGCAGCAATGCAAACGTCGCTTGTGCATTCAAGTTTGTCGTTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773491.1
MPVAASAIYFLNLRGDVLINRLYRDDVGGNMVDAFRVHIMQTKELGTCPVRQIGGCSFFYMRISNVYIVIVVSSNANVACAFKFVVEAVTLFKSYFGGSFDEDAIRNNFVLIYELLDEIMDFGYPQNLSPEILKLYITQEGVRSPFSSKTADKPVPNATLQVTGAVGWRREGLVYKKNEVFLDIVESVNLLMSSKGSVLRCDVTGKILMKCFLSGMPDLKLGLNDKIGLEKESQLKSRPAKSGKTIELDDVTFHQCVNLT...

XP_057773492.1
MPVAASAIYFLNLRGDVLINRLYRDDVGGNMVDAFRVHIMQTKELGTCPVRQIGGCSFFYMRISNVYIVIVVSSNANVACAFKFVVEAVTLFKSYFGGSFDEDAIRNNFVLIYELLDEIMDFGYPQNLSPEILKLYITQEGVRSPFSSKTADKPVPNATLQVTGAVGWRREGLVYKKNEVFLDIVESVNLLMSSKGSVLRCDVTGKILMKCFLSGMPDLKLGLNDKIGLEKESQLKSRPAKSGKTIELDDVTFHQCVNLT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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