当前解析结果
SmilChr07G003760| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003760 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003760 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003760 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 45925026 - 45925865 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994282 |
|---|---|
| GeneID | 130994282 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994282 |
| 原始查询 | SmilChr07G003760 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os12g0292200- identity=27.8; qcov=0.289; evalue=2.05e-07; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994282 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057775312.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057775312.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057775312.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775312.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775312.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:45925035 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 29 | A7,B100,B103,B107,B114,B121,B124,B125,B129,B130,B137,B45,B47,B48,B57,B65,B7,B92,B99,C24,C27,C3,C43,C44,C76,C77,C8,C86,D3 |
Chr7:45925037 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B101,B114,B14,B36,B57 |
Chr7:45925044 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C9 |
Chr7:45925046 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 6 | A2,B128,B25,C49,C70,C80 |
Chr7:45925047 |
T |
TGA |
2bp_insertion | stop_gained,frameshift_variant | 6 | A2,B128,B25,C49,C70,C80 |
Chr7:45925050 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B102,B37 |
Chr7:45925050 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B102,B37 |
Chr7:45925054 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B11,B118,B53 |
Chr7:45925078 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B26,C60,C77 |
Chr7:45925083 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B48,D5 |
Chr7:45925086 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B136,C60 |
Chr7:45925089 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | C60,C77 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。