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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003763`

染色体: Chr07 坐标: 45973873-45983250 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003763`
名称	SmilChr07G003763
描述	protein phosphatase 2C 29
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	45973873 - 45983250 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992777`
GeneID	`130992777`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992777`
原始查询	`SmilChr07G003763`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein phosphatase 2C 29
产物	protein phosphatase 2C 29
Arabidopsis	`AT2G35350` (PLL1) poltergeist like 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818102] identity=48.1; qcov=1.15; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0690500` (OsPP2C26) - identity=36; qcov=0.925; evalue=2.33e-84; confidence=medium
GO	GO:0004722 (protein serine/threonine phosphatase activity); GO:0006470 (protein dephosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00481 (PP2C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992777

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057773514.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057773515.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057773514.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057773515.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773514.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:45974355`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B23,C10,C12,C18,C35
`Chr7:45974355`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B23,C10,C12,C18,C35
`Chr7:45976375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B29,B61,C49,D11
`Chr7:45976416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B129,B3,C17,C36
`Chr7:45976451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C52
`Chr7:45981055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B113,C70
`Chr7:45981067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,D10
`Chr7:45981142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B66,B88,C26
`Chr7:45981182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B114,B17,B73,C30
`Chr7:45981871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B8,B93,C31
`Chr7:45981883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr7:45982559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773514.1

792 aa

396

792

PP2C

PF00481 PP2C 614-731 aa

XP_057773515.1

731 aa

366

731

PP2C

PF00481 PP2C 614-665 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773514.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	614	731	5.9e-28	98.9	Protein phosphatase 2C
`XP_057773515.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	614	665	2.2e-14	54.5	Protein phosphatase 2C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917532.1
AAACCCAGTTAGTATCTGTCTCTCTCTCCTGTGTTTCTCTCTCCTAACTGTAGTCTCAGCTCTCTGACTCTCTCCCCCTCTCTCTCTCTCTCGAAAAACGAAAGGAGAAACACAAACACCTACTACTACCAACACTACTACTTCCACCTTCTCCACCTTCTCTACCTTCCCCCATTCCCCCCTTTCATTTTATCACGCACTTTCTCAGCATTCCTTCCACCACTTGGATACGCACCGAGGATTCAACTCGGATTTTTTTC...

XM_057917531.1
AAACCCAGTTAGTATCTGTCTCTCTCTCCTGTGTTTCTCTCTCCTAACTGTAGTCTCAGCTCTCTGACTCTCTCCCCCTCTCTCTCTCTCTCGAAAAACGAAAGGAGAAACACAAACACCTACTACTACCAACACTACTACTTCCACCTTCTCCACCTTCTCTACCTTCCCCCATTCCCCCCTTTCATTTTATCACGCACTTTCTCAGCATTCCTTCCACCACTTGGATACGCACCGAGGATTCAACTCGGATTTTTTTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992777
ATGGGGGCGGGGTTCTCGCAGGTGTTCCCCTGTTTCAATCCGGCCGCCGCCGGTCCAAACCGGTCGGAGCCGGATGCCATTTTCGGCGGCAACGATGAAACCCTCGGCCACTCCTTCTGCTACGTCCGCTCGTCGGCGCGGTTCATCTCCCCCACTCACTCCGATCGCTTCGTCTCTCCCTCACAGTCCCTCCGCTTCGACGATCCGCGCCCCTCCAAACCGCCGGGTTACCCGGAGACCGGGTTCCGGGCCATCTCCGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773514.1
MGAGFSQVFPCFNPAAAGPNRSEPDAIFGGNDETLGHSFCYVRSSARFISPTHSDRFVSPSQSLRFDDPRPSKPPGYPETGFRAISGASVSANTSTPITVLQLDDICTDAAADAPNHHHYQNNCGSSKGFVAGAGPPNVLLDGFESTSSFSALPLQRVPRGGEQQPSGPLERAFFMSGPIERGALSGPLDGAPPGDSNGGVPFSAPLGGMYVKKRKKKSISGIRNALYRNFSVVPVRNFISGGGQRKDAPPGSDGCREAA...

XP_057773515.1
MGAGFSQVFPCFNPAAAGPNRSEPDAIFGGNDETLGHSFCYVRSSARFISPTHSDRFVSPSQSLRFDDPRPSKPPGYPETGFRAISGASVSANTSTPITVLQLDDICTDAAADAPNHHHYQNNCGSSKGFVAGAGPPNVLLDGFESTSSFSALPLQRVPRGGEQQPSGPLERAFFMSGPIERGALSGPLDGAPPGDSNGGVPFSAPLGGMYVKKRKKKSISGIRNALYRNFSVVPVRNFISGGGQRKDAPPGSDGCREAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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