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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003781`

染色体: Chr07 坐标: 46367986-46369325 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003781`
名称	SmilChr07G003781
描述	uncharacterized SmilChr07G003781
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	46367986 - 46369325 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994288`
GeneID	`130994288`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994288`
原始查询	`SmilChr07G003781`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0543900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os02g0543900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os02g0543900` - identity=39.4; qcov=0.822; evalue=1.06e-45; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13952 (DUF4216)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994288

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775317.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775317.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775317.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775317.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775317.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:46368139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr7:46368159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:46368201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	76	A1,A11,A14,A19,A22,A25,A3,A4,B102,B105,B109,B11,B112,B119,B123,B132,B133,B135,B136,B137,B15,B17,B23,B29,B31,B33,B34,B35,B37,B4,B46,B47,B52,B53,B56,B58,B59,B64,B75,B79,B80,B82,B83,B84,B85,B94,B96,C13,C15,C17,C19,C20,C21,C26,C27,C29,C31,C33,C36,C38,C41,C47,C48,C5,C52,C55,C61,C73,C75,C78,C8,C82,C87,D1,D5,D9
`Chr7:46368229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C1
`Chr7:46368322`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	27	B105,B15,B16,B32,B49,B56,B58,B59,B69,B74,B95,B96,C12,C19,C38,C4,C41,C43,C47,C49,C57,C60,C72,C76,C83,C84,D1
`Chr7:46368333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr7:46368347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B101
`Chr7:46368412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,C74
`Chr7:46368628`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C39
`Chr7:46368628`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C39
`Chr7:46368660`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,A25,B136,B34,C74
`Chr7:46368683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775317.1

259 aa

130

259

DUF4216

PF13952 DUF4216 85-158 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775317.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	85	158	2.4e-21	76.8	Domain of unknown function (DUF4216)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919334.1
TTAAAAAACTATGTCCGCACTAGAAGTCACCCTGAAGGATCTATAGCTGAGGGGTATCTCGCGGAAGAATGCATGGCATTCTGTTCAATGTATTTAAGCGATGTCGAGTCAAAGCTCAATAGACCAAATAGAAACAAAGAAGGCGGTGGGATTAGCCCAAACCAAGATGGTCGTTCTTTGGGAAAAGAAGAAATATTTATGTTGGACGACATTGAATGGATTCAAGCACATAGATATGTGCTCAATAGTCTATCAATTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994288
ATGATAAAAGCAAATAGAGAAATTGTTGACCAGGATATTCCATTTTTAGCTGCTGGGCCAAGTAAATGGGCTCGTTGTTACACGGGGTATATTGTAAATGGACTACGTTTTCATACTAAGAAACGTGAGATGCGAAGAAAAACCGAAAATAGTGGAATTTTCTTGACTGCTACTACCAATAGTTTCTCGAGTAGTAAGGATAAGAATCCTATAGCAGGAGACGTGTCATTCTATGGTGTTTTGAAGGATATAATAGAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775317.1
MIKANREIVDQDIPFLAAGPSKWARCYTGYIVNGLRFHTKKREMRRKTENSGIFLTATTNSFSSSKDKNPIAGDVSFYGVLKDIIEVRYTNNLKFILFKCDWVDYNLGLKRDEFNFTLVNFAHILYRGNRKIDEPFILAPQAQQAWYIQDPIDPDWHVALKMTPRAVFNVDPEVNEFESIEDEQVSCPQNDPDINNENISWTGADIDGVIVVDDIGEDNVDNFDDEDDEAEYFSRDKSDSDDDDDFFEHEIPSDENETN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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