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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003792`

染色体: Chr07 坐标: 46640093-46643596 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003792`
名称	SmilChr07G003792
描述	beta-amylase 3, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	46640093 - 46643596 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992798`
GeneID	`130992798`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992798`
原始查询	`SmilChr07G003792`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	beta-amylase 3, chloroplastic
产物	beta-amylase 3%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G17090` (CT-BMY) chloroplast beta-amylase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827419] identity=73; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0141200` (OsBamy2) - identity=64.3; qcov=0.784; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000272 (polysaccharide catabolic process); GO:0016161 (beta-amylase activity)
KEGG	smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01373 (Glyco_hydro_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992798

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057773527.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057773527.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773527.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773527.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773527.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:46640348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,D4
`Chr7:46640378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B61,C34,C65,C70
`Chr7:46640435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B125
`Chr7:46641295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr7:46641359`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,B87,C37,D4
`Chr7:46641385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr7:46642519`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B40
`Chr7:46642519`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B40
`Chr7:46642792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr7:46643005`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B87
`Chr7:46643005`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B87
`Chr7:46643093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773527.1

551 aa

276

551

Glyco_hydro_14

PF01373 Glyco_hydro_14 92-518 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773527.1`	Pfam	`PF01373`	Glyco_hydro_14	Domain	92	518	4.2e-219	728.6	Glycosyl hydrolase family 14

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917544.1
CAATTGGTTATCTTTATAAATAAACACCAGCAGCCTTCATTCTTTCCATATCTCTTCACTCAGAAAAAAAAGAAAAATGGCTTTAACACTTCATTCTTCCACCTCTCTTATGAAATCTAAAGATAACAGAAGTTCGAGAACTTCTGATGATCACACTAGTGCGGTTAGTTTTGCTCAGATGAAACAAACATCAAGCCAGCAGCGAGCAAAGAATTCAGCTCATGAAGCCCAACTTTTACCGACAGAAGGAATCTCCTCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992798
ATGGCTTTAACACTTCATTCTTCCACCTCTCTTATGAAATCTAAAGATAACAGAAGTTCGAGAACTTCTGATGATCACACTAGTGCGGTTAGTTTTGCTCAGATGAAACAAACATCAAGCCAGCAGCGAGCAAAGAATTCAGCTCATGAAGCCCAACTTTTACCGACAGAAGGAATCTCCTCGCATTCAGAAGGAAGGAATGAGCTGCGGGAGAAACTTCATGGGATGACAGCTCCTCATAGTCATAGCCACGAAAATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773527.1
MALTLHSSTSLMKSKDNRSSRTSDDHTSAVSFAQMKQTSSQQRAKNSAHEAQLLPTEGISSHSEGRNELREKLHGMTAPHSHSHENLRVPVFVMLPLDTISVGGNLNKPRAMLASLMALKSSGVEGVMVDVWWGLVEKDGPLKYNWEGYAELIKMVKKIGLKLQVVMSFHQCGGNVGDSCNIPLPPWVLEEISQNPDLVYTDKSGRRNPEYISLGCDSLAVLRGRTPIQVYSDFMRSFRKRFKDYIGDVVVEVQVGMGPC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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