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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003798`

染色体: Chr07 坐标: 46765445-46775960 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003798`
名称	SmilChr07G003798
描述	NAD-capped RNA hydrolase DXO1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	46765445 - 46775960 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992802`
GeneID	`130992802`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992802`
原始查询	`SmilChr07G003798`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAD-capped RNA hydrolase DXO1
产物	NAD-capped RNA hydrolase DXO1
Arabidopsis	`AT4G17620` (AT4G17620) glycine-rich protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827482] identity=74.5; qcov=0.778; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0392100` - identity=73; qcov=0.617; evalue=1.63e-169; confidence=high
GO	GO:0000956 (nuclear-transcribed mRNA catabolic process); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0034353 (mRNA 5'-diphosphatase activity); GO:0090305 (GO:0090305); GO:0110155 (NAD-cap decapping)
KEGG	-
Pfam	PF08652 (RAI1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992802

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057773535.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057773535.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057773535.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057773535.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773535.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:46765660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,A9,B35,B85,C4
`Chr7:46766318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr7:46772411`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B124,C16,C39,C41,C58,C61
`Chr7:46772483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	165	A10,A11,A13,A14,A16,A19,A20,A25,A3,A4,A7,A8,A9,B1,B10,B101,B104,B109,B11,B113,B12,B122,B123,B124,B125,B126,B128,B129,B13,B130,B135,B136,B137,B14,B140,B15,B17,B19,B21,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B31,B32,B33,B35,B36,B37,B38,B39,B40,B42,B43,B44,B45,B49,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B58,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B68,B69,B70,B72,B73,B74,B75,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B83,B85,B86,B87,B88,B9,B90,B91,B92,B93,B95,B97,B98,B99,C10,C12,C15,C16,C18,C19,C2,C20,C22,C23,C26,C27,C29,C3,C31,C32,C34,C35,C36,C39,C41,C43,C44,C45,C47,C48,C5,C53,C54,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C63,C65,C67,C68,C7,C71,C74,C75,C76,C77,C79,C8,C80,C82,C83,C84,C85,C87,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D7,D9
`Chr7:46772498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr7:46772958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:46773318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr7:46774416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr7:46775567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,B76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773535.1

540 aa

270

540

RAI1

PF08652 RAI1 225-527 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773535.1`	Pfam	`PF08652`	RAI1	Family	225	527	7e-85	285.9	RAI1 like PD-(D/E)XK nuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917552.1
TGGTGGGAATGGTTAGGTCGCACCCAAATCTTTGTCTAAACCTAATGAGATGGGATTAGTGTAGAGAAATAGAAACTTGGAATCCCTAGAGCAGTGAGCAGAGACAGAGAAAAAGTTGCAGAATTCATAATCCCCAACACCAAAAATGGACTTCGCTGAGCAAGCCATGAATTTATTCGGAGAATCCGAGGAAGAAGAAGAGGAAGATAACACCGCCACCGCCACCGCCACCAACACCAATAACAATTATTCCAACGACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992802
ATGGACTTCGCTGAGCAAGCCATGAATTTATTCGGAGAATCCGAGGAAGAAGAAGAGGAAGATAACACCGCCACCGCCACCGCCACCAACACCAATAACAATTATTCCAACGACGAGCAAGAAGAAGAGCAAGACAAAGAGCCGCAACGGAGCTCCTCCGCTTCGCCGTCGTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCAGCGGCTCCTCCTCCGCGGCATCTTCTTCGTCCTCCTCCTCGGCCAGCAGCAGCGCCGACGAAGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773535.1
MDFAEQAMNLFGESEEEEEEDNTATATATNTNNNYSNDEQEEEQDKEPQRSSSASPSSSSSSSSSGSSSAASSSSSSSASSSADEDEENDANRGEVRSSSYNNHDYNNNNDTNSHYYEHDEEVEDKDLFGSDNEDYVKTPVNSPHPVPVLPPIRITNNHARGGFARGRWQNDRGPGLLPRPGPYPQRQNFGYGPKFFNGPRDERFVSELKFKSEETLSRKATVFQEPCELACYSRVEGGDVYFDDRSLRLFKRLITEDIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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