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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003802`

染色体: Chr07 坐标: 46820140-46821456 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003802`
名称	SmilChr07G003802
描述	protein ALP1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	46820140 - 46821456 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994296`
GeneID	`130994296`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994296`
原始查询	`SmilChr07G003802`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALP1-like
产物	protein ALP1-like
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=55.7; qcov=0.242; evalue=1.2e-34; confidence=weak
Rice	`Os01g0872900` - identity=56.7; qcov=0.813; evalue=1.62e-149; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994296

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775326.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057775326.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775326.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775326.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775326.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:46820150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B140,B87
`Chr7:46820231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,C15,C18,C30
`Chr7:46820252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B135,B9,C40,C56
`Chr7:46820266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr7:46820269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,C15,C30
`Chr7:46820281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,B71,C81
`Chr7:46820323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,C55,C6
`Chr7:46820330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C81
`Chr7:46820341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	B128,B134,B69,B78,B81,B97,C31,C55,C60,C61,C82
`Chr7:46820342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C81
`Chr7:46820344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B101,B106,B123,B20
`Chr7:46820350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775326.1

438 aa

219

438

DUF8418

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF28509 DUF8418 66-104 aa PF04827 Plant_tran 173-376 aa PF13359 DDE_Tnp_4 204-367 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775326.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	66	104	2.4e-17	63.1	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057775326.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	173	376	2e-97	325.5	Plant transposon protein
`XP_057775326.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	204	367	3.3e-08	34.0	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919343.1
ATGTCTTCATCTTCTTCTGAATGTGATGTTGAAGAAACAGCTGCATCTGCAGCTGTAGCTGAAGCTGAAGCCTTTATGGAAGAGTACATGTGCCAATACATGGAGGATGATAGTATCCATCAACATGTGCTTCGAGCAATAGCGTCAAACACACCTCACACGAGAAGATATGTGCAAAGAGATCGGGAAGGAGCACACGAGCGACTCATGCGGGATTATTTTGATGATAATCCAACATGGGGTCCCAATGTATTTCGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994296
ATGTCTTCATCTTCTTCTGAATGTGATGTTGAAGAAACAGCTGCATCTGCAGCTGTAGCTGAAGCTGAAGCCTTTATGGAAGAGTACATGTGCCAATACATGGAGGATGATAGTATCCATCAACATGTGCTTCGAGCAATAGCGTCAAACACACCTCACACGAGAAGATATGTGCAAAGAGATCGGGAAGGAGCACACGAGCGACTCATGCGGGATTATTTTGATGATAATCCAACATGGGGTCCCAATGTATTTCGGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775326.1
MSSSSSECDVEETAASAAVAEAEAFMEEYMCQYMEDDSIHQHVLRAIASNTPHTRRYVQRDREGAHERLMRDYFDDNPTWGPNVFRRHFRMRKELFTRLVNALEAHNTWFQQRPDATGKKGFTPLQKCTNAIRQLAYGGPADHYDEYLRVSDTIGYECLRHFSRGVIEVFGGHYLRRPTVDDYQRLMEMHKQRDGFPGMLGSLDCMHWTWKNSPVAWKGQFTRGDHGVPTIMLEAVAYQDLWIWHAFFGVAGSNNDINVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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