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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003804`

染色体: Chr07 坐标: 46866565-46874120 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003804`
名称	SmilChr07G003804
描述	novel plant SNARE 11-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	46866565 - 46874120 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992807`
GeneID	`130992807`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992807`
原始查询	`SmilChr07G003804`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	novel plant SNARE 11-like
产物	novel plant SNARE 11-like
Arabidopsis	`AT2G35190` (NPSN11) Putative plant snare 11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818086] identity=79.7; qcov=1; evalue=2.61e-138; confidence=high
Rice	`Os06g0715100` (OsNPSN11) - identity=76.1; qcov=0.996; evalue=2.68e-131; confidence=high
GO	GO:0000149 (SNARE binding); GO:0005484 (SNAP receptor activity); GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0006890 (retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum); GO:0006906 (vesicle fusion); GO:0012507 (ER to Golgi transport vesicle membrane); GO:0031201 (SNARE complex); GO:0031902 (late endosome membrane)
KEGG	-
Pfam	PF03908 (Sec20)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992807

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	1.00000	`XP_057773537.1`
2	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057773537.1`
3	Secretory vesicle	Secretory vesicle	1.00000	`XP_057773538.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.80000	`XP_057773537.1`
5	Endosome	内体	0.80000	`XP_057773537.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:46872260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B117,B121,B124,C62
`Chr7:46872282`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A16,B121,B124
`Chr7:46872282`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A16,B121,B124
`Chr7:46872587`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B12,B122,B136,B44,B55,B72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773537.1

269 aa

134

269

Sec20

PF03908 Sec20 146-224 aa

XP_057773538.1

256 aa

128

256

Sec20

PF03908 Sec20 146-223 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773537.1`	Pfam	`PF03908`	Sec20	Domain	146	224	2.4e-07	31.3	Sec20
`XP_057773538.1`	Pfam	`PF03908`	Sec20	Domain	146	223	3.4e-07	30.8	Sec20

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917555.1
GGGAACTCTTTCCCTCAACCCCAACGAAAAGCCATGTCTTAACAAATGGGATAAATGTATACTATGAAAAACAATTTATGGTATTTGTTTTTAATTTTTTTGGATGAATTTTGAGTTTATACAATGGCAGAAATGTTTGTAAATCACGAGACCGCCAGCTCATAGCAGAGGCCGTCTCTCCCTCTCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCATCCTCCCCCAAAGTTTCCAATCAGATCCATCCACCACCCACCACCACATTGCT...

XM_057917554.1
GGGAACTCTTTCCCTCAACCCCAACGAAAAGCCATGTCTTAACAAATGGGATAAATGTATACTATGAAAAACAATTTATGGTATTTGTTTTTAATTTTTTTGGATGAATTTTGAGTTTATACAATGGCAGAAATGTTTGTAAATCACGAGACCGCCAGCTCATAGCAGAGGCCGTCTCTCCCTCTCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCATCCTCCCCCAAAGTTTCCAATCAGATCCATCCACCACCCACCACCACATTGCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992807
ATGGTGAGCGAAGAGCTCGCAGAGATCGAGGGCCAGATTCAAGATTTATTTCGAGCTCTATCGAATGGATTTCAAAAATTGGAGAAAATTAAGGACTCCAGCCGGCAAAGCAGGCAGCTGGAGGAGCTTACCGATAAGATGCGCGAATGTAAGAGGCTTATTAAAGAGTATGACCGAGAACTCAAAGACGCAGACTACAAAAATGACCCTAGTACAAACAAGATGCTTAATGAGAAAAAGCAATCAATGATCAAAGAGTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773537.1
MVSEELAEIEGQIQDLFRALSNGFQKLEKIKDSSRQSRQLEELTDKMRECKRLIKEYDRELKDADYKNDPSTNKMLNEKKQSMIKELNSYVALKKKYSSSLEHKRVDLFEGPGEGFAEDNVLLASNMTNQQLLDHGNNMMDETDQAIDRAKKVVHETINVGTETAAALKAQTEQMSRIVNELDSIHFSIKKASKLVKEIGRQVATDRCIMALLFLIVVGVIAIIIVKVRCLIAFLFCIWFTIKWLDFSDHWKRMLLWKIC...

XP_057773538.1
MVSEELAEIEGQIQDLFRALSNGFQKLEKIKDSSRQSRQLEELTDKMRECKRLIKEYDRELKDADYKNDPSTNKMLNEKKQSMIKELNSYVALKKKYSSSLEHKRVDLFEGPGEGFAEDNVLLASNMTNQQLLDHGNNMMDETDQAIDRAKKVVHETINVGTETAAALKAQTEQMSRIVNELDSIHFSIKKASKLVKEIGRQVATDRCIMALLFLIVVGVIAIIIVKIVNPNNKDIRDIPGLAPPAPTRKLLWISN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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