当前解析结果
SmilChr07G003822| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003822 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003822 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003822 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 47261770 - 47262135 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994302 |
|---|---|
| GeneID | 130994302 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994302 |
| 原始查询 | SmilChr07G003822 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994302 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.80000 | XP_057775331.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057775331.1 |
| 3 | Mitochondrion intermembrane space | Mitochondrion intermembrane space | 0.20000 | XP_057775331.1 |
| 4 | Mitochondrion matrix | 线粒体基质 | 0.20000 | XP_057775331.1 |
| 5 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 0.20000 | XP_057775331.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:47261773 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B14,B82,C39,C61 |
Chr7:47261816 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr7:47261824 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A3,A9,B100,C18,C4 |
Chr7:47261853 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 5 | B104,B108,B119,B122,B81 |
Chr7:47261853 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | B104,B108,B119,B122,B81 |
Chr7:47261907 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 33 | A14,A8,B102,B105,B12,B122,B131,B136,B22,B3,B30,B31,B44,B45,B47,B55,B66,B7,B75,B81,B88,C12,C14,C17,C42,C47,C65,C76,C84,C86,C9,D4,D6 |
Chr7:47261933 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B25,B29,B35,B85 |
Chr7:47261933 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B25,B29,B35,B85 |
Chr7:47261937 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B26 |
Chr7:47261937 |
T |
TA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | B26 |
Chr7:47261995 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B121,B129 |
Chr7:47262047 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B26 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。