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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003855`

染色体: Chr07 坐标: 47844877-47857612 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003855`
名称	SmilChr07G003855
描述	DNA repair endonuclease UVH1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	47844877 - 47857612 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994556`
GeneID	`130994556`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994556`
原始查询	`SmilChr07G003855`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA repair endonuclease UVH1
产物	DNA repair endonuclease UVH1
Arabidopsis	`AT5G41150` (UVH1) Restriction endonuclease, type II-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834117] identity=59.7; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0100400` (XPF) - identity=52.3; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000014 (single-stranded DNA endonuclease activity); GO:0000110 (nucleotide-excision repair factor 1 complex); GO:0000712 (resolution of meiotic recombination intermediates); GO:0000724 (double-strand break repair via homologous recombination); GO:0003684 (damaged DNA binding); GO:0003697 (single-stranded DNA binding); GO:1901255 (nucleotide-excision repair involved in interstrand cross-link repair)
KEGG	smil03420 (Nucleotide excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03460 (Fanconi anemia pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02732 (ERCC4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994556

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775581.1`
2	Nucleolus	核仁	0.60000	`XP_057775583.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775581.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775581.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775581.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:47846123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr7:47847952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B119,C31
`Chr7:47849891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B43,B44
`Chr7:47850249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C43,C87
`Chr7:47856571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr7:47856572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A8,B3,B81,B88
`Chr7:47856573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr7:47856634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775581.1

953 aa

476

953

ERCC4

PF02732 ERCC4 725-854 aa

XP_057775582.1

953 aa

476

953

ERCC4

PF02732 ERCC4 725-854 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775581.1`	Pfam	`PF02732`	ERCC4	Domain	725	854	2.9e-28	99.2	ERCC4 domain
`XP_057775582.1`	Pfam	`PF02732`	ERCC4	Domain	725	854	2.9e-28	99.2	ERCC4 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919598.1
CCATAGTACTCCATATAAATTTGAAGAGTTTCAAAGTGGAGCGAGTCAGCGCCAACTGCTTCACAAGTCACAATGGTGCAATTCCACCAACACATAATCAGCGATCTCCTGGAGGAGCCCAGCGGCGGCGTCGTTGTCCTCTCCGCCGGCCTCGGCCTCCCCAAACTCGTATCCTCCCTCCTCACACTCCATGACGCCTCCCAGGGCTCTGTCCTCATCCTCAACGCTTCTCCTTCCCAGAAGGCTTCCATCGACGCCGA...

XM_057919600.1
TCCATATAAATTTGAAGAGTTTCAAAGTGGAGCGAGTCAGCGCCAACTGCTTCACAAGTCACAATGGTGCAATTCCACCAACACATAATCAGCGATCTCCTGGAGGAGCCCAGCGGCGGCGTCGTTGTCCTCTCCGCCGGCCTCGGCCTCCCCAAACTCGTATCCTCCCTCCTCACACTCCATGACGCCTCCCAGGGCTCTGTCCTCATCCTCAACGCTTCTCCTTCCCAGAAGGCTTCCATCGACGCCGATTCTCGCTT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130994556
ATGGTGCAATTCCACCAACACATAATCAGCGATCTCCTGGAGGAGCCCAGCGGCGGCGTCGTTGTCCTCTCCGCCGGCCTCGGCCTCCCCAAACTCGTATCCTCCCTCCTCACACTCCATGACGCCTCCCAGGGCTCTGTCCTCATCCTCAACGCTTCTCCTTCCCAGAAGGCTTCCATCGACGCCGATTCTCGCTTCCCCTCCATGACCGCCGACCTCCCCGCTCACCAACGCCTCTCCCTCTACACCTCCGGTGGCAT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057775581.1
MVQFHQHIISDLLEEPSGGVVVLSAGLGLPKLVSSLLTLHDASQGSVLILNASPSQKASIDADSRFPSMTADLPAHQRLSLYTSGGIFFITARILIVDLLTRRLPATAISGILLLNAHSLSDTSTEAFIVRILRSSNSSLYVRAFSDCPQAMISGFAKAERILKCLFLRKLHLWPRFQVYVSQHLERDPPEVIDIRVPMSTYMIGIQKAVIEVMDACLKEMRKTNKVDVEDLTLENGLFKSFDEIVRRQLDPIWHTLGKR...

XP_057775582.1
MVQFHQHIISDLLEEPSGGVVVLSAGLGLPKLVSSLLTLHDASQGSVLILNASPSQKASIDADSRFPSMTADLPAHQRLSLYTSGGIFFITARILIVDLLTRRLPATAISGILLLNAHSLSDTSTEAFIVRILRSSNSSLYVRAFSDCPQAMISGFAKAERILKCLFLRKLHLWPRFQVYVSQHLERDPPEVIDIRVPMSTYMIGIQKAVIEVMDACLKEMRKTNKVDVEDLTLENGLFKSFDEIVRRQLDPIWHTLGKR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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