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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003860`

染色体: Chr07 坐标: 48071651-48075011 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003860`
名称	SmilChr07G003860
描述	expansin-like B1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	48071651 - 48075011 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994568`
GeneID	`130994568`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994568`
原始查询	`SmilChr07G003860`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	expansin-like B1
产物	expansin-like B1
Arabidopsis	`AT4G17030` (EXLB1) expansin-like B1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827411] identity=57.6; qcov=1; evalue=9.82e-102; confidence=high
Rice	`Os07g0496250` (EXLB1) - identity=40.7; qcov=0.902; evalue=8.06e-53; confidence=medium
GO	GO:0005576 (extracellular region)
KEGG	-
Pfam	PF01357 (Expansin_C); PF03330 (DPBB_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994568

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057775593.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057775593.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775593.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775593.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775593.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:48071939`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A16,A19,A3,B119,B28,B31,B6,B63,C56,C63,C67
`Chr7:48073028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr7:48073344`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A8,B3,B81,B88
`Chr7:48073355`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B79,C47
`Chr7:48073361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr7:48073380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B79,C47,C78
`Chr7:48073397`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B88
`Chr7:48073398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,B72
`Chr7:48073467`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B7,B72,C3,C42
`Chr7:48073488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A4,B10,B134,B18,B9,B95,C10,C29,C37,C54,C79,D1
`Chr7:48073529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C11
`Chr7:48073556`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A1,B117,B130,B139,B20,B3,B4,B41,B57,B64,B78,C17,C51,C52,C77,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775593.1

256 aa

128

256

DPBB_1

Expansin_C

PF03330 DPBB_1 68-143 aa PF01357 Expansin_C 156-239 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775593.1`	Pfam	`PF03330`	DPBB_1	Domain	68	143	1.5e-09	38.6	Lytic transglycolase
`XP_057775593.1`	Pfam	`PF01357`	Expansin_C	Domain	156	239	6.8e-17	62.1	Expansin C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919610.1
ATATATGTCATAACCAAAAAGTATTTGTTTTATGCAAGTGTTCTCCAATCAAGTGGTCACACTTTGGTTCAATTCCACTACTTGGATAAACAATTAAGAAAATTTGATTTCCAAGTGTCTTCCCCTCCCTAGCTTAGGTCGAACTATAAATATGGGATTCTCGCCGAGGATTTTGTGCACTCATATTAATACTTTATCAAAAAAGAGAGTCTTATTTGCTAGAAAATTTCATAAGTTATTACATATTGAATTCAATGGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994568
ATGGGTTCATCACACTATTACTACTTTGTGTTTTCAAAATTAGTGGGTGTTGTGGTAGTAGTGGGCGCAGCCCTCTGCTTGGCTGATGATGTGTATATTGGCACAAGAGCAACCTACTATGGAAGCCCTGATTGCAATGGAAATCCTACTGGAGCGTGTGGATATGGAGACTATGGAAGGACGGTATACAATGGGCAGGTCAGTGGAGTCTCCAGACTTTTCAGAAACGGCTCTGGCTGCGGTGCCTGCTACCGGGTTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775593.1
MGSSHYYYFVFSKLVGVVVVVGAALCLADDVYIGTRATYYGSPDCNGNPTGACGYGDYGRTVYNGQVSGVSRLFRNGSGCGACYRVRCKIAAHCSDEGTEVVATDYGEGHYTDFILSTRAYANLAKPNMAADLFAYGVVDVEYRRVPCRYASNLVVKVHERSSYPHYLAILPIYQSGINDVTAVQIWQEDCKEWREMRRVYGAVWDHQNPPLGAAISLRMQVVGGANAEAKWVQLSSVIAADWKAGLTYDAAIQLN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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