当前解析结果
SmilChr07G003864| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003864 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003864 |
| 描述 | bax inhibitor 1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 48113538 - 48116630 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994573 |
|---|---|
| GeneID | 130994573 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994573 |
| 原始查询 | SmilChr07G003864 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | bax inhibitor 1-like |
| 产物 | bax inhibitor 1-like |
| Arabidopsis | AT5G47120 (BI1)BAX inhibitor 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834758] identity=73.1; qcov=0.96; evalue=7.92e-121; confidence=high |
| Rice | Os02g0125300 (OsBI-1)- identity=66; qcov=0.96; evalue=3.04e-97; confidence=high |
| GO | GO:0016020 (membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01027 (Bax1-I) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994573 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057775597.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 1.00000 | XP_057775597.1 |
| 3 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.40000 | XP_057775597.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057775597.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775597.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:48113818 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B51 |
Chr7:48113963 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B129,B35,C32,C68 |
Chr7:48114239 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C46 |
Chr7:48114294 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B110,B122,C46,D2,D7 |
Chr7:48114295 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B110,B122,C46,D2,D7 |
Chr7:48115500 |
TGC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B126,B132,B42,B69,C33,D7 |
Chr7:48115503 |
A |
AAT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 6 | B126,B132,B42,B69,C33,D7 |
Chr7:48115662 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C31,C85 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057775597.1PF01027
Bax1-I 33-232 aa
XP_057775598.1PF01027
Bax1-I 33-235 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057775597.1 |
Pfam | PF01027 |
Bax1-I | Domain | 33 | 232 | 1.3e-47 | 163.1 | Inhibitor of apoptosis-promoting Bax1 |
XP_057775598.1 |
Pfam | PF01027 |
Bax1-I | Domain | 33 | 235 | 2.3e-48 | 165.5 | Inhibitor of apoptosis-promoting Bax1 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。