当前解析结果
SmilChr07G003881| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003881 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003881 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003881 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 48440398 - 48441269 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994318 |
|---|---|
| GeneID | 130994318 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994318 |
| 原始查询 | SmilChr07G003881 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994318 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057775347.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057775347.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775347.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775347.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057775347.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:48440438 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B134 |
Chr7:48440439 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A5,B101,B57,C74 |
Chr7:48440451 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B58 |
Chr7:48440487 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B103 |
Chr7:48440498 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A4,B115,B18,B2,B85 |
Chr7:48440502 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B95,C83 |
Chr7:48440606 |
G |
GGC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 5 | B104,B107,B122,B54,C46 |
Chr7:48440606 |
G |
GGC |
2bp_insertion | CDS_variant | 5 | B104,B107,B122,B54,C46 |
Chr7:48440607 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B83,C2 |
Chr7:48440632 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C18 |
Chr7:48440862 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C7 |
Chr7:48440867 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B83 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。