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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003891`

染色体: Chr07 坐标: 48727613-48728653 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003891`
名称	SmilChr07G003891
描述	uncharacterized SmilChr07G003891
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	48727613 - 48728653 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994323`
GeneID	`130994323`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994323`
原始查询	`SmilChr07G003891`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0508500; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os02g0508500; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G15685` (AT5G15685) mutator transposase MUDRA protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28721163] identity=28.2; qcov=0.809; evalue=1.83e-34; confidence=low
Rice	`Os02g0508500` - identity=36.6; qcov=0.734; evalue=5.85e-47; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03108 (DBD_Tnp_Mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994323

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775351.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775351.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775351.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775351.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775351.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:48727630`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A2,B102,B120,B135,B138,B3,B31,B38,B4,B41,B5,B6,B61,C1,C18,C26,C3,C43,C46,C6,C63,C65,C67,C81
`Chr7:48727667`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	11	B10,B31,B41,B42,B43,B56,B84,B96,C17,C58,C60
`Chr7:48727677`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B23,C13
`Chr7:48727677`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B23,C13
`Chr7:48727679`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	92	A10,A11,A2,A21,A22,A4,B1,B10,B101,B102,B104,B105,B107,B11,B117,B118,B120,B121,B125,B126,B129,B13,B131,B133,B134,B135,B136,B138,B139,B18,B3,B31,B35,B38,B4,B41,B42,B43,B48,B5,B50,B54,B56,B58,B60,B61,B73,B75,B78,B81,B83,B84,B87,B89,B9,B90,B92,B96,B98,B99,C1,C10,C17,C18,C21,C26,C29,C3,C30,C31,C32,C35,C43,C45,C46,C51,C53,C58,C6,C60,C63,C65,C67,C74,C76,C78,C79,C81,C84,C87,D11,D9
`Chr7:48727694`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	43	A10,A11,A21,A4,B1,B10,B101,B104,B105,B11,B129,B13,B131,B134,B136,B139,B18,B31,B35,B41,B42,B43,B56,B61,B73,B78,B83,B84,B9,B96,B98,C17,C29,C31,C32,C45,C46,C51,C58,C60,C63,C76,C78
`Chr7:48727698`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	45	A10,A11,A21,A4,B1,B10,B101,B104,B105,B11,B129,B13,B131,B134,B136,B139,B18,B31,B35,B41,B42,B43,B56,B61,B73,B78,B83,B84,B9,B96,B98,C17,C25,C29,C31,C32,C45,C46,C51,C53,C58,C60,C63,C76,C78
`Chr7:48727732`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B107,B117,D11
`Chr7:48727732`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B107,B117,D11
`Chr7:48727733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	29	A10,A11,A21,A4,B1,B101,B104,B105,B11,B129,B134,B136,B139,B18,B35,B75,B78,B96,B98,C30,C31,C32,C45,C46,C51,C53,C74,C76,C78
`Chr7:48727747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B63,B91,D6,D7
`Chr7:48727802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775351.1

346 aa

173

346

DBD_Tnp_Mut

MULE

PF03108 DBD_Tnp_Mut 54-116 aa PF10551 MULE 245-317 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775351.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	54	116	1.2e-06	28.8	MuDR family transposase
`XP_057775351.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	245	317	5.4e-09	37.0	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919368.1
ATGAATTTCAATGAGTTAGAGGTCAGTGGGAATATTTCAGAGTATGAAGAGAGTGATGGGTATGTTAATACTGATGAGAGTGACTTAGATGCTGAGACCAGTAAGCTTAAGTCTAAGAAAACGGTTTATGATCCTACTTGTGATCATAAAACCTTAGAATTCCAGCTAGGCATGAGGTTTGACAATGGTTGGGTTTGTAGAGATGCATTGAAGACATGGGCTATAGAGAATGGAAAGCATATTAGATTCAAGAGAGTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994323
ATGAATTTCAATGAGTTAGAGGTCAGTGGGAATATTTCAGAGTATGAAGAGAGTGATGGGTATGTTAATACTGATGAGAGTGACTTAGATGCTGAGACCAGTAAGCTTAAGTCTAAGAAAACGGTTTATGATCCTACTTGTGATCATAAAACCTTAGAATTCCAGCTAGGCATGAGGTTTGACAATGGTTGGGTTTGTAGAGATGCATTGAAGACATGGGCTATAGAGAATGGAAAGCATATTAGATTCAAGAGAGTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775351.1
MNFNELEVSGNISEYEESDGYVNTDESDLDAETSKLKSKKTVYDPTCDHKTLEFQLGMRFDNGWVCRDALKTWAIENGKHIRFKRVNADQCEAYCKPPCKWRVYGSIVGATKTFKIKTLGENHSCSRDMNNKLVGSKWIATKYLNIFRLRPNISVEELKADLWERFSTRVGVDRLYKARSLAREMVRGSVDEHYGMLRRYLAELRRVDKDGRYELLLGEENIFKGLYIGISQLIGGFKRGCRPIIGLDGCFLKTYLGGIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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