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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003900`

染色体: Chr07 坐标: 49048153-49054632 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003900`
名称	SmilChr07G003900
描述	protein RADIALIS-like 3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	49048153 - 49054632 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994603`
GeneID	`130994603`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994603`
原始查询	`SmilChr07G003900`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein RADIALIS-like 3
产物	protein RADIALIS-like 3
Arabidopsis	`AT3G11280` (AT3G11280) Duplicated homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820299] identity=41.4; qcov=1.11; evalue=2.5e-30; confidence=medium
Rice	`Os04g0676700` (MYB) - identity=41; qcov=0.986; evalue=2.17e-27; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994603

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775638.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775638.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775638.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775638.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775638.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:49050441`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B10,B107,B134,B18,B51,B56,B82,B9,B96,C10,C12,C53,C79,D2
`Chr7:49050462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B29,D6
`Chr7:49050462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,D6
`Chr7:49050588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr7:49050639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,B29,D6
`Chr7:49050673`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,B29,D6
`Chr7:49050721`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A5,A8,B106,B2,B60,B71,B8,C25,C58,C62,C65,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775638.1

141 aa

141

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 29-72 aa PF00249 Myb_DNA-binding 111-139 aa

XP_057775639.1

141 aa

141

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 29-72 aa PF00249 Myb_DNA-binding 111-139 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775638.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	29	72	1.6e-18	67.3	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057775638.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	111	139	1.6e-18	67.3	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057775639.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	29	72	1.6e-18	67.3	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057775639.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	111	139	1.6e-18	67.3	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919655.1
AAAAATTTCAACTCAGCATAAAACACTACTCTGAAACTAAAATTTAGTCAAAATTCGTGAAATTATTTAGCATTAACCCTTTAAAAGCAGCAGTATTCGCATATTCTTCTTCTTCTTCTTTTTTTAAATATAACAACATATTCCGGAAAACAAAAGAGAAAAATCAATATGGTTATTTTCTGTTGCATATCGCCAACTTACCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACACACACACACACACACATAAGTTTTAC...

XM_057919656.1
ATTAACCCTTTAAAAGCAGCAGTATTCGCATATTCTTCTTCTTCTTCTTTTTTTAAATATAACAACATATTCCGGAAAACAAAAGAGAAAAATCAATATGGTTATTTTCTGTTGCATATCGCCAACTTACCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACACACACACACACACACATAAGTTTTACCATTTAGCTGGGTTCATTGCAAAAATCAATCTTGGAGGTTGGATCACACTTGCAAGAAAACCCAGTTAGTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130994603
ATGGATACAGATTGGACATTTGACAGCTGCTCCTTGAGGACGGAGGTGGATGATGCTGCATCAAAGGATGCATGCACAAGTTCGAATTGGACAAGGGAGGAGGACAAGGCGTTCGAGAATGCTCTGGCAACCTACTATAATGATGCCGATATGTGGGATAAGATCGCATTGGCAGTTCCTGGAAAAACAATTGAAGATCTAAAACTTCACTATGAAGTCTTGCGTCGTGATGTGGAGGCCATTGAGTCTGGCAAGGTACC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057775638.1
MDTDWTFDSCSLRTEVDDAASKDACTSSNWTREEDKAFENALATYYNDADMWDKIALAVPGKTIEDLKLHYEVLRRDVEAIESGKVPLPDNPTKASTLKEKKKSEQAQRGDPWTEEEHRQFLYGLQRFGRGDWKNISRYSV

XP_057775639.1
MDTDWTFDSCSLRTEVDDAASKDACTSSNWTREEDKAFENALATYYNDADMWDKIALAVPGKTIEDLKLHYEVLRRDVEAIESGKVPLPDNPTKASTLKEKKKSEQAQRGDPWTEEEHRQFLYGLQRFGRGDWKNISRYSV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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