当前解析结果
SmilChr07G003907| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003907 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003907 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003907 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 49253826 - 49258808 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994610 |
|---|---|
| GeneID | 130994610 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994610 |
| 原始查询 | SmilChr07G003907 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994610 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057775648.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057775648.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.40000 | XP_057775648.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.20000 | XP_057775648.1 |
| 5 | P-body | P-body | 0.20000 | XP_057775648.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:49255316 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B85,C33,D6 |
Chr7:49255317 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A23,B31,B54,B91,C9 |
Chr7:49255331 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B135,C32 |
Chr7:49255341 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C6,C74 |
Chr7:49255360 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B85,B98,C83 |
Chr7:49255362 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C28,C44 |
Chr7:49255364 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B114,B55,D11 |
Chr7:49255367 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B128,B133,B35,C24 |
Chr7:49255372 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B114,B55,D11 |
Chr7:49255381 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | C14,C34,C76,D10 |
Chr7:49255397 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A10,A21,B12,B23,C37 |
Chr7:49255402 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A10,A21,B12,C37,C56 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。