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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003908`

染色体: Chr07 坐标: 49267504-49271075 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003908`
名称	SmilChr07G003908
描述	probable L-gulonolactone oxidase 6
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	49267504 - 49271075 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994611`
GeneID	`130994611`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994611`
原始查询	`SmilChr07G003908`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable L-gulonolactone oxidase 6
产物	probable L-gulonolactone oxidase 6
Arabidopsis	`AT2G46760` (GulLO6) D-arabinono-1,4-lactone oxidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819289] identity=62.9; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0563100` - identity=59.6; qcov=0.969; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003885 (D-arabinono-1,4-lactone oxidase activity); GO:0016020 (membrane); GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	smil00053 (Ascorbate and aldarate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01565 (FAD_binding_4); PF04030 (ALO); PF22906 (GULLO2-like_3rd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994611

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057775649.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057775649.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057775649.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775649.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775649.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:49267864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B15,C72,C82
`Chr7:49267915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,C25,C65
`Chr7:49267980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr7:49268742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B94
`Chr7:49268769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B46,C20,C31,C85
`Chr7:49268775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr7:49268798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B131,B23
`Chr7:49268817`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B46,C20,C31,C85
`Chr7:49268918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr7:49269031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B140,C41
`Chr7:49269596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B106,B24,B53,D5
`Chr7:49269629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B78,C11,C67,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775649.1

582 aa

291

582

FAD_binding_4

ALO

GULLO2-like_3rd

PF01565 FAD_binding_4 62-191 aa PF04030 ALO 386-524 aa PF22906 GULLO2-like_3rd 536-575 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775649.1`	Pfam	`PF01565`	FAD_binding_4	Domain	62	191	3e-18	66.6	FAD binding domain
`XP_057775649.1`	Pfam	`PF04030`	ALO	Family	386	524	1.6e-11	45.1	D-arabinono-1,4-lactone oxidase
`XP_057775649.1`	Pfam	`PF22906`	GULLO2-like_3rd	Domain	536	575	8.5e-22	77.3	L-gulonolactone oxidase 2-like, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919666.1
TGTCGTGTAACTGGCTTTTTGTCGGTTTCTTACAAGATTGATTACTCAAACTTTGAAGCTACTTAACCCATAGGAGCTGGTAGCAATACTTAGTCGCAACTCCACTTGATTCTTCATCAAAAACATATTCTATAAGGAGAAAAAATTGAAGTCATTGCTCCCACATATGAGAGGATAATCAACATGAACATCATCAACAGCATCGTGCTATTGGTAACAATATTAACGAGCAACGCCGCCGTGACCGTGAGGTGCAGCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994611
ATGAACATCATCAACAGCATCGTGCTATTGGTAACAATATTAACGAGCAACGCCGCCGTGACCGTGAGGTGCAGCCCGCCGGAAGATCCGATCGAGTGCAAGGGGGCGGCGAGGAACTCAAACTGCACGATCACCAACTCGTACGGCGCCTTCCCGGACAGGAGCACCTGCCGCGCGGCCGAGGCCGTGTACCCGACGTCGGAGGCGGAGCTGGTGGCGGCCGTGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGGGAGGAAGATCAAGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775649.1
MNIINSIVLLVTILTSNAAVTVRCSPPEDPIECKGAARNSNCTITNSYGAFPDRSTCRAAEAVYPTSEAELVAAVAAAAAAGRKIKVATRYSHSITKLVCPDGEEGVLISTKYLNRTLEVDAAGMSMTVESGVTLRQLIGEAARAGMAVPYAPYWWGLTVGGMMGTGAHGSSLWGLGSQVHDRVTRLTIVSPARPHLRVLEAGDPDLDAAKVSLGVLGVISQVTLKLEGLFKRSVTYVTKNDSDLGEQVVGFGRQHEFAD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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