当前解析结果
SmilChr07G003911| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003911 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003911 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003911 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 49331621 - 49342716 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994325 |
|---|---|
| GeneID | 130994325 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994325 |
| 原始查询 | SmilChr07G003911 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994325 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057775355.1 |
| 2 | Cytoplasmic vesicle | 细胞质囊泡 | 0.20000 | XP_057775355.1 |
| 3 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.20000 | XP_057775355.1 |
| 4 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057775355.1 |
| 5 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.20000 | XP_057775355.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:49331638 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A6,B28,B98,C52 |
Chr7:49331644 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A6,B28,B98,C52 |
Chr7:49331651 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | C29,C6,C64,C74 |
Chr7:49331656 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B55 |
Chr7:49331659 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A6,B28,B98,C52,D5 |
Chr7:49331687 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 25 | A23,A7,B10,B100,B102,B114,B119,B125,B19,B36,B42,B43,B45,B55,B69,B9,C21,C38,C44,C52,C54,C56,C77,C80,D5 |
Chr7:49331692 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C50 |
Chr7:49331697 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | D10 |
Chr7:49331697 |
AC |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:49331716 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B109 |
Chr7:49331720 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B60 |
Chr7:49331752 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B106 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。