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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003932`

染色体: Chr07 坐标: 49635727-49638633 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003932`
名称	SmilChr07G003932
描述	expansin-A18-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	49635727 - 49638633 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994629`
GeneID	`130994629`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994629`
原始查询	`SmilChr07G003932`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	expansin-A18-like
产物	expansin-A18-like
Arabidopsis	`AT1G12560` (EXPA7) expansin A7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837813] identity=63.2; qcov=0.985; evalue=4.81e-120; confidence=high
Rice	`Os10g0535900` (EXPA30) - identity=63.7; qcov=0.936; evalue=1.45e-116; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0009664 (plant-type cell wall organization)
KEGG	-
Pfam	PF01357 (Expansin_C); PF03330 (DPBB_1); PF22514 (EXPB1_D1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994629

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057775670.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057775670.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775670.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775670.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775670.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:49635879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B126,B40,C33,C60
`Chr7:49635890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C31,C6,C85
`Chr7:49637283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B47,B87
`Chr7:49637295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B35
`Chr7:49637338`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B30
`Chr7:49637338`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775670.1

265 aa

132

265

EXPB1_D1

DPBB_1

Expansin_C

PF22514 EXPB1_D1 44-166 aa PF03330 DPBB_1 74-160 aa PF01357 Expansin_C 171-249 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775670.1`	Pfam	`PF22514`	EXPB1_D1	Domain	44	166	2.4e-08	35.2	EXPB1-like domain 1
`XP_057775670.1`	Pfam	`PF03330`	DPBB_1	Domain	74	160	9.8e-20	71.3	Lytic transglycolase
`XP_057775670.1`	Pfam	`PF01357`	Expansin_C	Domain	171	249	3.5e-26	91.8	Expansin C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919687.1
TATAGTGGCAAAAATAGAGGTGAAGAAAAACTCATGGCTTCAAATTTGCTTTATTCATGGTGCCTTGGCATATTCATGGTGTTAACGGCGGTGGTTGGCGGAGCAGCGGCGGCGGGATATTCCGCCGCAGGATTTCAGCCTAGTCCATGGAAACAAGCCTATGCCACATTTTATGGCGATGAAACGGCTTCCGCCACCATGGGCGGAGCATGCGGGTACGGAAACTTGTTCAGCACCGGTTACGGCACCGACACGGCGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994629
ATGGCTTCAAATTTGCTTTATTCATGGTGCCTTGGCATATTCATGGTGTTAACGGCGGTGGTTGGCGGAGCAGCGGCGGCGGGATATTCCGCCGCAGGATTTCAGCCTAGTCCATGGAAACAAGCCTATGCCACATTTTATGGCGATGAAACGGCTTCCGCCACCATGGGCGGAGCATGCGGGTACGGAAACTTGTTCAGCACCGGTTACGGCACCGACACGGCGGCGTTGAGCACGGTGCTGTTCAGCAATGGGTATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775670.1
MASNLLYSWCLGIFMVLTAVVGGAAAAGYSAAGFQPSPWKQAYATFYGDETASATMGGACGYGNLFSTGYGTDTAALSTVLFSNGYGCGQCFQLRCINSKWCNKGSAITTVTATNLCPPNWSEDSNNGGWCNPPRTHFDMAKPAFMKIAQWNGGIVPVSFRRVACVRKGGIKFRFEGNGYWLLVYVMNVGGGGDVANMWVKGGKTNWISMSHNWGASYQAFATLGGQPLSFKITSYTTHQVLVVNNVAPANWQVGITYTA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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