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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003934`

染色体: Chr07 坐标: 49660520-49664238 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003934`
名称	SmilChr07G003934
描述	leucoanthocyanidin dioxygenase
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	49660520 - 49664238 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994631`
GeneID	`130994631`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994631`
原始查询	`SmilChr07G003934`

查看完整 ID 对照表

文献序列与新 ID 证据

这些记录来自论文中明确给出的 accession，并通过序列比对映射到当前参考版本。网站定位属于计算预测；论文中的实验定位和互作单独列出。

论文基因名	Accession	当前 ID	比对	置信度	来源
`SmANS` CORE-051; 2019	`MK704422`	`LOC130994631` `SmilChr07G003934` GeneID 130994631	nucleotide CDS and protein BLAST against active nuclear reference, 2026-09-27; identity 98.468%; coverage 100.0%	Exact or near-exact sequence match	DOI

打开完整文献证据

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	leucoanthocyanidin dioxygenase
产物	leucoanthocyanidin dioxygenase
Arabidopsis	`AT4G22880` (LDOX) leucoanthocyanidin dioxygenase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828387] identity=77.7; qcov=0.924; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0372500` (ANS) - identity=50.7; qcov=0.951; evalue=4.45e-133; confidence=high
GO	-
KEGG	smil00941 (Flavonoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994631

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775674.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057775674.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775674.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775674.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775674.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:49660659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr7:49660890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr7:49661046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr7:49661053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr7:49663488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr7:49663570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C78,C85
`Chr7:49663707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr7:49663718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B83,C51,C59
`Chr7:49663764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,C32,C68
`Chr7:49663819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B9,C79
`Chr7:49663893`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B15,B9,C18,C79
`Chr7:49663898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775674.1

369 aa

184

369

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 54-167 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 219-314 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775674.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	54	167	4.4e-26	92.6	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057775674.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	219	314	6.1e-31	107.5	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919691.1
CATGCATTTCCACCCTAACATACTTTCATTTCATAAACTTCATCTACAATTTTCTAACAAAAAAGAAAAAACAAATGGTTGCTACACCGGCTCCAACTCCAAGCCCGCGGGTTGAGGAACTGGCCCGAAGCGGGCTCGACACCATCCCCAAAGACTACGTACGGCCCGAAGAAGAGCTCAAAAGCATCCGCGACATTTTCGCGGAAGAGAAAAGCATCCTCGACGGGCCGCAGCTGCCGACGATCGATCTGGACGAGATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994631
ATGGTTGCTACACCGGCTCCAACTCCAAGCCCGCGGGTTGAGGAACTGGCCCGAAGCGGGCTCGACACCATCCCCAAAGACTACGTACGGCCCGAAGAAGAGCTCAAAAGCATCCGCGACATTTTCGCGGAAGAGAAAAGCATCCTCGACGGGCCGCAGCTGCCGACGATCGATCTGGACGAGATCGACTCCAGTGACGAGGAGACGCGGCGGAGGTGCTACGACGAGGTGAAGAAGGCGGCGATGGATTGGGGGGTGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775674.1
MVATPAPTPSPRVEELARSGLDTIPKDYVRPEEELKSIRDIFAEEKSILDGPQLPTIDLDEIDSSDEETRRRCYDEVKKAAMDWGVMHLINHGIPEELTSRVKAAGKEFFELPVEEKEKYANEQAAGNVQGYGSKLANNASGQLEWEDYFFHCVLPEEKRDLSIWPKHPADYIPTTCEYAKQLRGLATKILSVLSIGLGLEQGRLEKEVGGLEDLILQMKINFYPKCPQPELALGVEAHTDVSALTFILHNMVPGLQLFY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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