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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003936`

染色体: Chr07 坐标: 49692427-49697324 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003936`
名称	SmilChr07G003936
描述	B-type cell cycle switch protein ccs52A-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	49692427 - 49697324 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994632`
GeneID	`130994632`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994632`
原始查询	`SmilChr07G003936`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	B-type cell cycle switch protein ccs52A-like
产物	B-type cell cycle switch protein ccs52A-like
Arabidopsis	`AT4G22910` (FZR2) FIZZY-related 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828390] identity=77.9; qcov=0.933; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0123300` (OsCCS52A) - identity=70.6; qcov=0.977; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005680 (anaphase-promoting complex); GO:0010997 (anaphase-promoting complex binding); GO:0031145 (anaphase-promoting complex-dependent catabolic process); GO:1904668 (positive regulation of ubiquitin protein ligase activity); GO:1905786 (positive regulation of anaphase-promoting complex-dependent catabolic process); GO:1990757 (ubiquitin ligase activator activity)
KEGG	smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00400 (WD40); PF12894 (ANAPC4_WD40); PF24807 (WD40_CDC20-Fz)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994632

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775675.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775675.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775675.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775675.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775675.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:49692612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B126,B40,C60
`Chr7:49692853`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr7:49694784`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C71,D10
`Chr7:49694803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:49694822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C71
`Chr7:49694954`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C77
`Chr7:49694954`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C77
`Chr7:49695261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr7:49696910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775675.1

480 aa

240

480

WD40_CDC20-Fz

ANAPC4_WD40

WD40

PF24807 WD40_CDC20-Fz 165-454 aa PF12894 ANAPC4_WD40 195-266 aa PF00400 WD40 212-242 aa PF00400 WD40 247-278 aa PF00400 WD40 290-325 aa PF00400 WD40 330-370 aa PF00400 WD40 419-455 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775675.1`	Pfam	`PF24807`	WD40_CDC20-Fz	Repeat	165	454	6.6e-127	423.5	CDC20/Fizzy WD40 domain
`XP_057775675.1`	Pfam	`PF12894`	ANAPC4_WD40	Repeat	195	266	4.8e-14	53.1	Anaphase-promoting complex subunit 4 WD40 domain
`XP_057775675.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	212	242	5.5e-30	103.2	WD domain, G-beta repeat
`XP_057775675.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	247	278	5.5e-30	103.2	WD domain, G-beta repeat
`XP_057775675.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	290	325	5.5e-30	103.2	WD domain, G-beta repeat
`XP_057775675.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	330	370	5.5e-30	103.2	WD domain, G-beta repeat
`XP_057775675.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	419	455	5.5e-30	103.2	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919692.1
ATACATTTATTCTCCCGCAGTAAATCTCTACTCTCACATATAATTCCCGGGAAAATCCAACCAATCTCCTCCACAAGCATACCCGATTCACCGCCGCGCCGCTGCCGCTGCCGCCGCCGCCCACGTGATCTCCGACCACATGGATTCCCCCAGCACGAGCACATTCTCCCCCGACACCAAAACTCCGCCGCCGAAGCTTCTCGGCGCCTCCTACCGCCGCCCCTCTTCCTCCCGCACAATTTACGGGGATCGCTTCATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994632
ATGGATTCCCCCAGCACGAGCACATTCTCCCCCGACACCAAAACTCCGCCGCCGAAGCTTCTCGGCGCCTCCTACCGCCGCCCCTCTTCCTCCCGCACAATTTACGGGGATCGCTTCATCCCCAGCCGCTCCTCTTCCAATTTCGCCCTCTTCAATCTGCCTAATTCCAGCTCCAATGCCTCTTCCGAAGATTCCAATTCGGCCTACATCAACCTCTTAAAGTCCGCCCTTTTCGGACCTGAATGCGTCAGCGGATTTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775675.1
MDSPSTSTFSPDTKTPPPKLLGASYRRPSSSRTIYGDRFIPSRSSSNFALFNLPNSSSNASSEDSNSAYINLLKSALFGPECVSGFQPLTPEKSASGGRFGGRSTSNGSVFQTSPPNCNIFKYKTETRKSLHSLSPFGFDDQLPGVPHSPVKAPRKVPRSPYKVLDAPALQDDFYLNLVDWSSHNVLAVGLGNCVYLWHASSSKVVKLCDLGSDDSVCSVGWAQRNTHLAVGTSNGKLQLWDASRCKRIRTMDGHRMRVG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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