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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003942`

染色体: Chr07 坐标: 49787762-49790269 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003942`
名称	SmilChr07G003942
描述	uncharacterized SmilChr07G003942
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	49787762 - 49790269 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994335`
GeneID	`130994335`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994335`
原始查询	`SmilChr07G003942`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0106900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os08g0106900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G28950` (AT5G28950) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833021] identity=64.3; qcov=0.395; evalue=6.99e-41; confidence=low
Rice	`Os08g0106900` - identity=47.6; qcov=0.847; evalue=1.41e-60; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF26138 (DUF8040)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994335

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775366.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057775366.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057775366.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775366.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775366.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:49787858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B29,C27,D1
`Chr7:49787873`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B52
`Chr7:49787873`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B52
`Chr7:49789646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,C18
`Chr7:49789765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr7:49789948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr7:49789984`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C12
`Chr7:49789984`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C12
`Chr7:49790035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:49790060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:49790146`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,B86,C80
`Chr7:49790168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B5,B76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775366.1

248 aa

124

248

DUF8040

DDE_Tnp_1

DDE_Tnp_4

PF26138 DUF8040 37-97 aa PF01609 DDE_Tnp_1 127-226 aa PF13359 DDE_Tnp_4 133-234 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775366.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	37	97	2.6e-13	50.4	Domain of unknown function (DUF8040)
`XP_057775366.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	127	226	5.4e-06	27.0	Transposase DDE domain
`XP_057775366.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	133	234	6.8e-13	49.3	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919383.1
ATGAATTATGAAGATAAAATTGAAGATGAAATTGAAGAAGAAATGGAAGATGAAATTGAAACAGAAATGGAGCTTGAATATTATGATCAGGTTAGGCTTTTGATGGAGGCAACTAAGATCATTAGAGAGAAAACTCATGTTCAAGATACACGATACACAACTGTTGAAGAAATGGTGGCAACATTCTTGATCATTGTTGGACACAACGATCGTTATTGTAATGTTCGTCAAAGGTTTAATCGTTCACATTTTGCTACTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994335
ATGAATTATGAAGATAAAATTGAAGATGAAATTGAAGAAGAAATGGAAGATGAAATTGAAACAGAAATGGAGCTTGAATATTATGATCAGGTTAGGCTTTTGATGGAGGCAACTAAGATCATTAGAGAGAAAACTCATGTTCAAGATACACGATACACAACTGTTGAAGAAATGGTGGCAACATTCTTGATCATTGTTGGACACAACGATCGTTATTGTAATGTTCGTCAAAGGTTTAATCGTTCACATTTTGCTACTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775366.1
MNYEDKIEDEIEEEMEDEIETEMELEYYDQVRLLMEATKIIREKTHVQDTRYTTVEEMVATFLIIVGHNDRYCNVRQRFNRSHFATSQNFNKILRALNTIAPDMMVKPTTAIPAKIRESTRFYHFFKDCIGAIDGTHIPVMITGRDVSSYRNRHGVQSQNVLAACNFDLQFIYVLSGWEGSAHDSKLLTNALSRPNGLHVPQGKYFLVDCGFANRRQFLAPMRGVRYHLKDFGGEGRHPRNADELFNL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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