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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003943`

染色体: Chr07 坐标: 49801828-49811414 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003943`
名称	SmilChr07G003943
描述	uncharacterized SmilChr07G003943
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	49801828 - 49811414 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994637`
GeneID	`130994637`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994637`
原始查询	`SmilChr07G003943`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FAM63A-like protein (DUF544) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826793]; symbol=AT4G11860; hit=AT4G11860; species=arabidopsis; confidence=high
产物	FAM63A-like protein (DUF544) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826793]; symbol=AT4G11860; hit=AT4G11860; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G11860` (AT4G11860) FAM63A-like protein (DUF544) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826793] identity=50.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0712400` - identity=45.2; qcov=1.03; evalue=1.47e-178; confidence=high
GO	GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity); GO:0005829 (cytosol); GO:0016807 (cysteine-type carboxypeptidase activity); GO:0071108 (protein K48-linked deubiquitination); GO:0071944 (cell periphery); GO:1990380 (K48-linked deubiquitinase activity)
KEGG	-
Pfam	PF04424 (MINDY_DUB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994637

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775683.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057775683.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057775683.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057775683.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775683.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:49802039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B20,B48,B64,C47,C84
`Chr7:49807482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr7:49811023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775683.1

684 aa

342

684

MINDY_DUB

PF04424 MINDY_DUB 29-580 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775683.1`	Pfam	`PF04424`	MINDY_DUB	Domain	29	580	2.1e-91	306.6	MINDY deubiquitinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919700.1
CCCCTCTATTTTTCTGCAATTCGACATTTTGTTTTTTTTACACACAAGTGTTTGACATCTTCAAGATTCAGAAGCATTTACATATGGATTCTTCTTCTACATTGCCACCTTCGACCTCCGGCGCGCCGCCGCAGCGGGAGCCGGAGACCACGCTGGATGAGATTTTGTACAAGACGAAAGCGATTGAATTCTTCGGCCGAACAGCTCCCATCATTCTCCAAAACAACAATGGCCCCTGCCCTCTCCTCTCTATATGTAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994637
ATGGATTCTTCTTCTACATTGCCACCTTCGACCTCCGGCGCGCCGCCGCAGCGGGAGCCGGAGACCACGCTGGATGAGATTTTGTACAAGACGAAAGCGATTGAATTCTTCGGCCGAACAGCTCCCATCATTCTCCAAAACAACAATGGCCCCTGCCCTCTCCTCTCTATATGTAATGTTCTCTCCCTGAAGAACAGTTTGAGTTTGAGCCTGGATATGCCAGAGGTTTCACAGGATAAATTGCTCTCTCTGGTTGCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775683.1
MDSSSTLPPSTSGAPPQREPETTLDEILYKTKAIEFFGRTAPIILQNNNGPCPLLSICNVLSLKNSLSLSLDMPEVSQDKLLSLVADRLIDSNSKVDNKDAGYVKNQQQNIADAIDLLPRLTTGIDVNIKFRRIDDFEFTPECAIFDLLDIPLYHGWIVDPQDIETADAIGSKSYNTLMGELVSLETQAMECEQNKNLEEDSVDFVAATTAVLGVPSPSLSRSQSFTDSPQSVKKGDMEEEEEVLRVLKLSEAEILSSAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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