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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003961`

染色体: Chr07 坐标: 50293326-50301655 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003961`
名称	SmilChr07G003961
描述	cucumisin-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	50293326 - 50301655 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994655`
GeneID	`130994655`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994655`
原始查询	`SmilChr07G003961`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cucumisin-like
产物	cucumisin-like
Arabidopsis	`AT5G59190` (AT5G59190) subtilase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836037] identity=47; qcov=0.915; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0624100` (OsSub51) - identity=42.4; qcov=0.975; evalue=3.76e-168; confidence=medium
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00082 (Peptidase_S8); PF05922 (Inhibitor_I9); PF17766 (fn3_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994655

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057775700.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057775700.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057775700.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775700.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775700.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:50293552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B65,B87,D11,D6
`Chr7:50293790`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr7:50293791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr7:50293928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr7:50294020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr7:50294053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr7:50294070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B140,B2
`Chr7:50294113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr7:50295118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C68,D10
`Chr7:50295177`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B49,C66,D2
`Chr7:50295177`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B49,C66,D2
`Chr7:50295194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775700.1

774 aa

387

774

Inhibitor_I9

Peptidase_S8

fn3_6

PF05922 Inhibitor_I9 30-107 aa PF00082 Peptidase_S8 128-578 aa PF17766 fn3_6 633-732 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775700.1`	Pfam	`PF05922`	Inhibitor_I9	Domain	30	107	7.9e-20	72.0	Peptidase inhibitor I9
`XP_057775700.1`	Pfam	`PF00082`	Peptidase_S8	Domain	128	578	1.3e-46	160.0	Subtilase family
`XP_057775700.1`	Pfam	`PF17766`	fn3_6	Domain	633	732	6e-28	97.7	Fibronectin type-III domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919717.1
TATCACAAATACTAATTAGTCGATCGAGATGGTGAAAGCAGCAGTGTTTTCGCTTCTCTATCCTCTGTTGCTTTCAGCTCTTGTGCTCAACTGCCAATGTCAACACAGGACTCTTCACGTTGTCTACATGGGAGCTAGGCCCGACGGCGATGTGTCGGTTGCATCCACGCATCATTCCATGTTGCATAAAGTACTTGGAAGTGCGAGTTCTGCGAAAGAATCACTGGTTTACAGCTACGGCAGAAGCTTCAACGGATTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994655
ATGGTGAAAGCAGCAGTGTTTTCGCTTCTCTATCCTCTGTTGCTTTCAGCTCTTGTGCTCAACTGCCAATGTCAACACAGGACTCTTCACGTTGTCTACATGGGAGCTAGGCCCGACGGCGATGTGTCGGTTGCATCCACGCATCATTCCATGTTGCATAAAGTACTTGGAAGTGCGAGTTCTGCGAAAGAATCACTGGTTTACAGCTACGGCAGAAGCTTCAACGGATTCGCGGCCAAGCTGAGTAATGAGGAAGCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775700.1
MVKAAVFSLLYPLLLSALVLNCQCQHRTLHVVYMGARPDGDVSVASTHHSMLHKVLGSASSAKESLVYSYGRSFNGFAAKLSNEEAKRIAEMEGVVSVNKNQVYKLHTTRSWDFLNLTTDKLGAPPQSDVVIALLDTGVWPEHPSFNDSGFGSPPAKWKGACTGQNFTCNNKIIGARFYNSDGYSGGEDQSARDTEGHGTHTASTASGVEVEASYFGVAEGVARGGVPKSRVAVYKVCWSFGCNSADILKAFDDAIVDGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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