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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003971`

染色体: Chr07 坐标: 50551497-50555195 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003971`
名称	SmilChr07G003971
描述	malate synthase, glyoxysomal-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	50551497 - 50555195 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994343`
GeneID	`130994343`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994343`
原始查询	`SmilChr07G003971`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	malate synthase, glyoxysomal-like
产物	malate synthase%2C glyoxysomal-like
Arabidopsis	`AT5G03860` (MLS) malate synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831690] identity=66.5; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0486950` (MS) - identity=63.6; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004474 (malate synthase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006097 (glyoxylate cycle)
KEGG	smil00620 (Pyruvate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00630 (Glyoxylate and dicarboxylate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01274 (MS_TIM-barrel); PF20656 (MS_N); PF20659 (MS_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994343

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057775374.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775374.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775374.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775374.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775374.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:50551612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr7:50551627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B87,C42
`Chr7:50551638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr7:50551673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,D6
`Chr7:50551675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr7:50551679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,A2,B140,B66,B78
`Chr7:50551691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:50551713`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B140
`Chr7:50551713`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B140
`Chr7:50551720`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B140
`Chr7:50551720`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B140
`Chr7:50551721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,B78,C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775374.1

519 aa

260

519

MS_N

MS_TIM-barrel

MS_C

PF20656 MS_N 13-76 aa PF01274 MS_TIM-barrel 167-390 aa PF20659 MS_C 399-507 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775374.1`	Pfam	`PF20656`	MS_N	Domain	13	76	8.1e-18	64.4	Malate synthase, N-terminal domain
`XP_057775374.1`	Pfam	`PF01274`	MS_TIM-barrel	Domain	167	390	2.3e-87	292.8	Malate synthase, TIM barrel domain
`XP_057775374.1`	Pfam	`PF20659`	MS_C	Domain	399	507	1.2e-21	78.0	Malate synthase, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919391.1
ATGGTGAGTGTAGATGCGAGGGGCTATGATGTGCCAGAGGGAGTTAAAATAAGGGGAAGATATGATGAAGAATTTGCTTCAATTTTGAGCAAGGATGCTCTGCAGTTTGTTGTGGATTTGCAGAGAGAGTTCATGAAAGATATTGAGTATGCTATGGATTGCAGGAAGGAGGCTCAGGTGAGGTACAATAATGGGGAGTTGCCGGGGTTCGATCCGGCGACCAAGTACGTCAGAGAAGGCGAGTGGGCCTGCGCAGCCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994343
ATGGTGAGTGTAGATGCGAGGGGCTATGATGTGCCAGAGGGAGTTAAAATAAGGGGAAGATATGATGAAGAATTTGCTTCAATTTTGAGCAAGGATGCTCTGCAGTTTGTTGTGGATTTGCAGAGAGAGTTCATGAAAGATATTGAGTATGCTATGGATTGCAGGAAGGAGGCTCAGGTGAGGTACAATAATGGGGAGTTGCCGGGGTTCGATCCGGCGACCAAGTACGTCAGAGAAGGCGAGTGGGCCTGCGCAGCCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775374.1
MVSVDARGYDVPEGVKIRGRYDEEFASILSKDALQFVVDLQREFMKDIEYAMDCRKEAQVRYNNGELPGFDPATKYVREGEWACAAVPPAVADRRVEITGPVDRKMVINAHNSGAQVFMADFEDAVSASWEKMVRGQVNLRDAMSGTIMFHEEGSDTVYKLNQRIATLFVRPRGCHLPESHILIDGRPAAACLVDFGLYFFHNCSIFRQTQGQGFGPFFYLPQMEHSREARIWNRVFEKAEKVAGIDRGSIRATVLIETL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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