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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003990`

染色体: Chr07 坐标: 50956390-50962506 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003990`
名称	SmilChr07G003990
描述	cytochrome P450 87A3-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	50956390 - 50962506 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994678`
GeneID	`130994678`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994678`
原始查询	`SmilChr07G003990`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome P450 87A3-like
产物	cytochrome P450 87A3-like
Arabidopsis	`AT1G12740` (CYP87A2) cytochrome P450, family 87, subfamily A, polypeptide 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837830] identity=65.5; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0675400` - identity=56.1; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016125 (sterol metabolic process); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994678

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057775731.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057775731.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775731.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775731.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775731.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:50956820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A8,B3,B81
`Chr7:50956826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B51
`Chr7:50956955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B111,B115,B75
`Chr7:50957055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr7:50959230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B129,B36,B64,B90,B91,B92,B97,C63,D11
`Chr7:50959240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:50959255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B87
`Chr7:50959306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B111,B75
`Chr7:50959311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A16,B127,B6,B63,B83,C35,C44,C56,C63,C67,C71
`Chr7:50959580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B102,B109,B23,B26,B78,C40,C45,C82
`Chr7:50959658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,C47,C84
`Chr7:50960007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C5,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775731.1

468 aa

234

468

p450

PF00067 p450 30-451 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775731.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	30	451	1.7e-62	212.4	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919748.1
AACCTCAACTCTCTAGCTAGCTAATTTTGTATAACAAAATTGGTTGTAGATTAATACGATCAGAAATAATGTTTGCCTTAGTTTTAACGGTGCTGGTGATCCTCATTGCAAAGTGGGTTCACAGATGCTGGACTCCCAAGTGCAACGGCACGCTCCCACCGGGCTCGATGGGCTTGCCACTGCTCGGGGAGACTCTGCACTTCCTCGCTTCGACCACCTCCAACGATGTTCCTCCTTTCCTGCGTAATAGGATGCAGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994678
ATGTTTGCCTTAGTTTTAACGGTGCTGGTGATCCTCATTGCAAAGTGGGTTCACAGATGCTGGACTCCCAAGTGCAACGGCACGCTCCCACCGGGCTCGATGGGCTTGCCACTGCTCGGGGAGACTCTGCACTTCCTCGCTTCGACCACCTCCAACGATGTTCCTCCTTTCCTGCGTAATAGGATGCAGAAGTATGGGCCTGTTTTCAAGACTAGTTTGGTGGGGCAGGCGATGATCGTGTCAACGGATGCCGATCTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775731.1
MFALVLTVLVILIAKWVHRCWTPKCNGTLPPGSMGLPLLGETLHFLASTTSNDVPPFLRNRMQKYGPVFKTSLVGQAMIVSTDADLNYFIFQKEGELFESWYPDTFTKIFGTQNLSNLHGFLFKYVKNMVLNLVGSERLIAMLPEIEGASSRCLKTWSGHDSVDVRETTAQMIFDLTAKKLISYDSEKSSEDLRGYFEAFIKGLISFPFNIPGTSYYQCLQGRKKALKMLKNMLQERRERPRETQSDFFDYVLKEVERED...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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