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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004000`

染色体: Chr07 坐标: 51074577-51077027 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004000`
名称	SmilChr07G004000
描述	proteasome subunit beta type-5-B-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	51074577 - 51077027 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994689`
GeneID	`130994689`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994689`
原始查询	`SmilChr07G004000`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	proteasome subunit beta type-5-B-like
产物	proteasome subunit beta type-5-B-like
Arabidopsis	`AT3G26340` (AT3G26340) N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822238] identity=84.1; qcov=0.996; evalue=2.77e-168; confidence=high
Rice	`Os06g0153800` (OsPBE1) - identity=75.5; qcov=1.02; evalue=4.52e-152; confidence=high
GO	GO:0004298 (threonine-type endopeptidase activity); GO:0005839 (proteasome core complex); GO:0051603 (GO:0051603)
KEGG	smil03050 (Proteasome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00227 (Proteasome)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994689

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775739.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057775739.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775739.1`
4	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057775739.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775739.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:51074800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr7:51075425`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr7:51075434`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B88
`Chr7:51075434`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B88
`Chr7:51075438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,B88
`Chr7:51075488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,D4
`Chr7:51076583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,C87,D4
`Chr7:51076588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A21,B12,B28,C86
`Chr7:51076609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B79,B82,C37
`Chr7:51076757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B32,B79,C18,C73,C86
`Chr7:51076798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,A21,B28,D5
`Chr7:51076834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,B79,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775739.1

272 aa

136

272

Proteasome

PF00227 Proteasome 54-234 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775739.1`	Pfam	`PF00227`	Proteasome	Domain	54	234	1.3e-52	179.0	Proteasome subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919756.1
CAATCTCACTCATAATGTCATAGCTCTCAACTTCTCGTCTTTCTCGCTACACACAAATCCCCAAAGTCGCAAAACACAGAAATCCTTTTCCACCTCCCCAAGTTTCCGATCAGCAACAACGGCGAGCAAAGCCGCCGTCGCCGGCTTCCGCCACCTCCTCCCTCATATCTCCTATAAATTATCTTAATTTGATGAAGATTGATTTTAGTGGGCTCGATCCCGCCATGCCGGTTAGGGCAAATGCGGATGATTTGGATAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994689
ATGAAGATTGATTTTAGTGGGCTCGATCCCGCCATGCCGGTTAGGGCAAATGCGGATGATTTGGATAACGAGATTTTGGCTGCACCATCGTTTAAACTTCCTGTCACTGTTGATTATGATGGGTTTCAGAAAGCAGCAGTGCAGATGGTGAAGCCAGCCAAGGGAACGACAACTCTGGCTTTTATATTCAAAGATGGTGTCATGGTGGCTGCTGATTCGCGTGCGAGCATGGGAGGATATATTTCATCACAATCTGTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775739.1
MKIDFSGLDPAMPVRANADDLDNEILAAPSFKLPVTVDYDGFQKAAVQMVKPAKGTTTLAFIFKDGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGIKCRLHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGMGLSVGTMIAGWDEKGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDSGYRFDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYHVGPSGWKKLSGDDVGELHYTYYPVEPT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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