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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004018`

染色体: Chr07 坐标: 51250948-51256552 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004018`
名称	SmilChr07G004018
描述	DNA glycosylase/AP lyase ROS1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	51250948 - 51256552 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994702`
GeneID	`130994702`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994702`
原始查询	`SmilChr07G004018`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA glycosylase/AP lyase ROS1-like
产物	DNA glycosylase/AP lyase ROS1-like
Arabidopsis	`AT2G36490` (DML1) demeter-like 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818224] identity=52.6; qcov=0.37; evalue=1.74e-72; confidence=low
Rice	`Os01g0218032` (ROS1A) - identity=53.9; qcov=0.349; evalue=1.26e-71; confidence=low
GO	GO:0006284 (base-excision repair); GO:0019104 (DNA N-glycosylase activity); GO:0035514 (DNA demethylase activity); GO:0080111 (GO:0080111)
KEGG	-
Pfam	PF15628 (RRM_DME)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994702

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775755.1`
2	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057775755.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775756.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775756.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775756.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:51251138`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	55	A1,A11,A16,A21,A23,A24,A25,B101,B103,B104,B112,B117,B124,B13,B130,B136,B139,B15,B26,B27,B3,B37,B4,B41,B44,B45,B46,B52,B59,B71,B73,B75,B78,B80,B85,B86,B87,B98,B99,C1,C16,C28,C37,C46,C48,C5,C51,C52,C59,C7,C75,C86,D1,D11,D6
`Chr7:51251158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:51251180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr7:51251188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr7:51252080`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	27	A20,B1,B105,B108,B111,B115,B17,B18,B21,B36,B37,B62,B64,B65,B69,B80,B93,C1,C12,C26,C38,C47,C50,C6,C84,D6,D7
`Chr7:51252562`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	151	A10,A11,A15,A18,A19,A20,A21,A23,A3,A4,A5,A6,A8,A9,B10,B101,B106,B107,B109,B112,B113,B117,B118,B119,B12,B120,B122,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B132,B133,B134,B135,B137,B138,B14,B140,B16,B2,B22,B23,B25,B28,B31,B33,B34,B37,B39,B4,B40,B45,B46,B48,B49,B50,B53,B54,B55,B56,B59,B6,B60,B62,B63,B66,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B78,B79,B80,B82,B83,B88,B89,B90,B91,B92,B93,B95,B97,B98,C10,C13,C14,C16,C17,C18,C2,C20,C21,C27,C28,C29,C30,C32,C33,C34,C36,C39,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C48,C49,C53,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C71,C72,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C82,C83,C87,C9,D1,D10,D2,D4,D7,D8,D9
`Chr7:51252648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr7:51252679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr7:51253867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr7:51254269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B36,B37,B69
`Chr7:51254528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:51254636`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775755.1

721 aa

360

721

RRM_DME

PF15628 RRM_DME 603-703 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775755.1`	Pfam	`PF15628`	RRM_DME	Family	603	703	7.2e-39	132.8	RRM in Demeter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009091888.1
TTCACCTTCTTCTCCAAAATCATACTCTTACACTAGACCGGCTCTCTCATCTAAATCTTCCATCTCCCACGTCACCACATCACACGCCTCATCTCTCGCTCTCAGCTAATCTCAGCAGCTGTGGGCAGAGTATGCATTTTGCATCTAATTACAACTGCAATCTTTGCCTGAACCGCACCGCCGTCAACACTTGATCTCGAAAAGAAGAAGTCAGGATCAGAAAATGGGCGAGAGTTCAAAAGAGGGTGGCCGTGCTTGCC...

XM_057919772.1
TTCACCTTCTTCTCCAAAATCATACTCTTACACTAGACCGGCTCTCTCATCTAAATCTTCCATCTCCCACGTCACCACATCACACGCCTCATCTCTCGCTCTCAGCTAATCTCAGCAGCTGTGGGCAGAGTATGCATTTTGCATCTAATTACAACTGCAATCTTTGCCTGAACCGCACCGCCGTCAACACTTGATCTCGAAAAGAAGAAGTCAGGATCAGAAAATGGGCGAGAGTTCAAAAGAGGGTGGCCGTGCTTGCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130994702
ATGGGCGAGAGTTCAAAAGAGGGTGGCCGTGCTTGCCTCAAATCATGCAAACCAAACAATATCTCTCTGATCACTTATACAAGGCATCGTTGGCGAAGCAAGATAGAAACCAGAAATAAAAATGAACAAGAACAACATGATGCTTTTATAGAAAATCAATCAGAAAATGTGAGTGAAAAAGGCGAAGCTGAGGATGTACAAGTTTCCGGGGGCAGCTTGATTTCGGCATTTGCTCCAGCTGTACAAGTTTCCGGGGGCAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057775755.1
MGESSKEGGRACLKSCKPNNISLITYTRHRWRSKIETRNKNEQEQHDAFIENQSENVSEKGEAEDVQVSGGSLISAFAPAVQVSGGNLISAFAPTLQVSGGSLISALDPTSLFGSTSRMPKTGSYVKLSDVPAPATPDIVARYGKASAMDSKKRTCCRSLNLDTRNLKRKAAEADKDYEILTPTGCIRERDEEERDGLDRQINLFMSRMNQIQGVRTFSEWKGSVMDSIVGAYLAQNVKDELSSSAFMSLAAKFPRDAAG...

XP_057775756.1
MGESSKEGGRACLKSCKPNNISLITYTRHRWRSKIETRNKNEQEQHDAFIENQSENVSEKGEAEDVQVSGGSLISAFAPAVQVSGGNLISAFAPTLQVSGGSLISALDPTSLFGSTSRMPKTGSYVKLSDVPAPATPDIVARYGKASAMDSKKRTCCRSLNLDTRNLKRKAAEADKDYEILTPTGCIRERDEEERDGLDRQINLFMSRMNQIQGVRTFSEWKGSVMDSIVGAYLAQNVKDELSSSAFMSLAAKFPRDAAG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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