当前解析结果
SmilChr07G004055| 统一新 Gene ID | SmilChr07G004055 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G004055 |
| 描述 | remorin-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 51857466 - 51859942 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994734 |
|---|---|
| GeneID | 130994734 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994734 |
| 原始查询 | SmilChr07G004055 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | remorin-like |
| 产物 | remorin-like |
| Arabidopsis | AT3G61260 (AT3G61260)Remorin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825298] identity=62.6; qcov=0.898; evalue=3.72e-48; confidence=medium |
| Rice | Os04g0533300 (OsREM1.5)- identity=67.5; qcov=0.92; evalue=1.11e-52; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF03763 (Remorin_C) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994734 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057775783.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057775783.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057775783.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775783.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775783.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057775783.1PF03763
Remorin_C 25-130 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057775783.1 |
Pfam | PF03763 |
Remorin_C | Family | 25 | 130 | 4.9e-30 | 104.2 | Remorin, C-terminal region |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。