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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004076`

染色体: Chr07 坐标: 52213855-52216430 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004076`
名称	SmilChr07G004076
描述	bystin-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	52213855 - 52216430 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994752`
GeneID	`130994752`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994752`
原始查询	`SmilChr07G004076`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	bystin-like
产物	bystin-like
Arabidopsis	`AT1G31660` (AT1G31660) bystin-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840053] identity=53.7; qcov=0.863; evalue=2.8e-25; confidence=medium
Rice	`Os09g0352400` - identity=57.8; qcov=0.874; evalue=2.3e-27; confidence=medium
GO	GO:0005730 (nucleolus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006364 (rRNA processing); GO:0030515 (snoRNA binding); GO:0030688 (preribosome, small subunit precursor)
KEGG	-
Pfam	PF05291 (Bystin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994752

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.60000	`XP_057775796.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057775796.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057775796.1`
4	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057775796.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775796.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:52215849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	121	A10,A11,A16,A19,A20,A21,A22,A23,A3,A5,B100,B102,B103,B104,B107,B110,B112,B113,B115,B117,B118,B120,B123,B125,B126,B129,B13,B130,B131,B132,B134,B135,B137,B138,B14,B140,B16,B2,B22,B27,B28,B29,B32,B33,B35,B38,B39,B44,B47,B5,B50,B52,B53,B56,B58,B62,B63,B64,B65,B70,B72,B74,B78,B79,B80,B81,B85,B94,B97,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C17,C18,C19,C2,C21,C22,C23,C24,C25,C28,C29,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C38,C39,C4,C40,C41,C44,C46,C49,C50,C55,C58,C59,C6,C60,C67,C69,C7,C71,C72,C73,C75,C79,C80,C83,C86,C87,D1,D5,D7
`Chr7:52215869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr7:52215870`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	126	A10,A11,A16,A19,A20,A21,A22,A23,A3,A5,A7,B100,B102,B103,B104,B107,B110,B112,B113,B115,B117,B118,B120,B123,B125,B126,B129,B13,B130,B131,B132,B134,B135,B137,B138,B14,B140,B16,B2,B22,B24,B27,B28,B29,B32,B33,B35,B38,B39,B44,B46,B47,B5,B50,B52,B53,B56,B58,B62,B63,B64,B65,B70,B72,B74,B78,B79,B80,B81,B85,B90,B94,B97,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C17,C18,C19,C2,C21,C22,C23,C24,C25,C28,C29,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C38,C39,C4,C40,C41,C44,C46,C49,C50,C53,C55,C58,C59,C6,C60,C67,C69,C7,C71,C72,C73,C75,C79,C80,C83,C86,C87,D1,D5,D9
`Chr7:52216045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C82,C83
`Chr7:52216307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,B40,C32
`Chr7:52216320`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A10,B80,B83,C18,C8
`Chr7:52216320`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A10,B80,B83,C18,C8
`Chr7:52216333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B80,B83,C18,C8
`Chr7:52216377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr7:52216391`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775796.1

95 aa

Bystin

PF05291 Bystin 11-83 aa

XP_057775797.1

95 aa

Bystin

PF05291 Bystin 11-83 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775796.1`	Pfam	`PF05291`	Bystin	Repeat	11	83	1.3e-19	71.3	Bystin
`XP_057775797.1`	Pfam	`PF05291`	Bystin	Repeat	11	83	1.3e-19	71.3	Bystin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009091910.1
AGGATGATATTAATGAGGAGGAAGAAAAGTTGATGGATGCCTTTCTATCAAAAGATGATCGCCCTGAACGAACATTGGCTGACATCATTGTGGAGAAGATCAAGGAAAAAGATGCCCAAGTTTCATCTGGAGCACAACCAATGCCGAAATTGGACAACTCCATCATTGAGCTGTACAAGGGGGTTGGTAAACTGCTTAACAAGTACACCTCTGGCAAGATGCCCAAAGCTTTCAAGCACGTACCTTCTCTGCAATTCTGG...

XR_009091909.1
AGGATGATATTAATGAGGAGGAAGAAAAGTTGATGGATGCCTTTCTATCAAAAGATGATCGCCCTGAACGAACATTGGCTGACATCATTGTGGAGAAGATCAAGGAAAAAGATGCCCAAGTTTCATCTGGAGCACAACCAATGCCGAAATTGGACAACTCCATCATTGAGCTGTACAAGGGGGTTGGTAAACTGCTTAACAAGTACACCTCTGGCAAGATGCCCAAAGCTTTCAAGCACGTACCTTCTCTGCAATTCTGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130994752
ATGGATGCCTTTCTATCAAAAGATGATCGCCCTGAACGAACATTGGCTGACATCATTGTGGAGAAGATCAAGGAAAAAGATGCCCAAGTTTCATCTGGAGCACAACCAATGCCGAAATTGGACAACTCCATCATTGAGCTGTACAAGGGGGTTGGTAAACTGCTTAACAAGTACACCTCTGGCAAGATGCCCAAAGCTTTCAAGCACGTACCTTCTCTGCAATTCTGGGAAGAAGTTTTATACAAGACAGCCCTAGTTTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057775796.1
MDAFLSKDDRPERTLADIIVEKIKEKDAQVSSGAQPMPKLDNSIIELYKGVGKLLNKYTSGKMPKAFKHVPSLQFWEEVLYKTALVCFVFLVILN

XP_057775797.1
MDAFLSKDDRPERTLADIIVEKIKEKDAQVSSGAQPMPKLDNSIIELYKGVGKLLNKYTSGKMPKAFKHVPSLQFWEEVLYKTALVCFVFLVILN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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